67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0695 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 254 aa  503  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  88.26 
 
 		 260 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  82.21 
 
 		 260 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  74.31 
 
 		 265 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  77.2 
 
 		 259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  77.2 
 
 		 259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  73.58 
 
 		 253 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  76.44 
 
 		 266 aa  334  7.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  73.39 
 
 		 254 aa  318  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  71.6 
 
 		 253 aa  318  7e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  68.87 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  68.48 
 
 		 253 aa  305  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  68.72 
 
 		 253 aa  296  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  68.9 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  72.77 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  60 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  70.33 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  60.73 
 
 		 244 aa  261  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  60.19 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  58.17 
 
 		 244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  64.35 
 
 		 245 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  59.51 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  56.22 
 
 		 245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  47.15 
 
 		 248 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  47.25 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  54.78 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  47.52 
 
 		 244 aa  199  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  48.98 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  49.58 
 
 		 251 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  48.98 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  52.05 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  55.3 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  55.98 
 
 		 243 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  55.92 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  56.25 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  48.39 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  46.32 
 
 		 241 aa  181  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  44.17 
 
 		 245 aa  180  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  47.25 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  44.58 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  47.47 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  44.17 
 
 		 247 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  47.37 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  46.51 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  57.38 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  46.51 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  46.61 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  41.84 
 
 		 241 aa  168  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  47.13 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  45.68 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  44.77 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  45.68 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  45.27 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  40.5 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  26.44 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  27.84 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  27.23 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  25.91 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  29.19 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.16 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.51 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  26.01 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  26.07 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  29.86 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  29.02 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  35.29 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0368  trbJ protein  28.72 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>