69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3545 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 259 aa  509  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 259 aa  509  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  76.11 
 
 		 260 aa  351  5.9999999999999994e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  79.91 
 
 		 260 aa  347  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  78.63 
 
 		 254 aa  344  8.999999999999999e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  73.12 
 
 		 253 aa  334  7.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  77.68 
 
 		 254 aa  330  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  71.94 
 
 		 253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  71.88 
 
 		 253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  70.85 
 
 		 253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  70.49 
 
 		 265 aa  325  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  68.77 
 
 		 253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  70.35 
 
 		 266 aa  300  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  72.05 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  70.68 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  60.49 
 
 		 245 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  72.8 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  64.34 
 
 		 244 aa  281  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  61.45 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  62.33 
 
 		 245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  62.1 
 
 		 244 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  66.51 
 
 		 245 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  57.61 
 
 		 258 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  50.22 
 
 		 249 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  55.11 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  45.45 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  49.18 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  54.82 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  47.95 
 
 		 251 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  47.95 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  51.15 
 
 		 244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  53.7 
 
 		 244 aa  198  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  54.82 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  55.87 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  58.29 
 
 		 240 aa  195  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  47.41 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  47.71 
 
 		 246 aa  191  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  43.02 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  45.1 
 
 		 247 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  47.41 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  59.39 
 
 		 238 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  46.54 
 
 		 245 aa  186  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  42.25 
 
 		 245 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  42.25 
 
 		 242 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  47 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  45.87 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  45 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  47.23 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  46.38 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  46.78 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  46.78 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  44.76 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  40.33 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  39.58 
 
 		 242 aa  121  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  28.02 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.31 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  28.77 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  26.24 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.02 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.9 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  24.63 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  34.26 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  26.09 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  22.76 
 
 		 269 aa  49.3  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5610  hypothetical protein  24.8 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  30.68 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5186  type IV secretory pathway, entry exclusion protein A (putative protein precursor)  27.27 
 
 		 263 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4748  hypothetical protein  26.61 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1521  hypothetical protein  27.27 
 
 		 263 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>