65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1504 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 244 aa  481  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  73.77 
 
 		 245 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  71.95 
 
 		 254 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  74.55 
 
 		 245 aa  295  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  70.67 
 
 		 253 aa  288  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  75 
 
 		 245 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  66.24 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  69.68 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  61.45 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  61.45 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  66.97 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  68.44 
 
 		 256 aa  262  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  71.62 
 
 		 252 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  62.18 
 
 		 244 aa  254  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  66.39 
 
 		 253 aa  254  7e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  64.35 
 
 		 254 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  60 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  62.96 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  60.18 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  59.26 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  59.26 
 
 		 266 aa  241  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  55.41 
 
 		 249 aa  238  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  61.89 
 
 		 244 aa  235  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  62.33 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  55.56 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  51.21 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  54.34 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  51.25 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  58.02 
 
 		 243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  53.68 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  46.28 
 
 		 247 aa  194  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  44.86 
 
 		 245 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  44.86 
 
 		 247 aa  189  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  47.93 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  44.87 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  47.93 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  53.33 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  48.39 
 
 		 243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  47.95 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  46.76 
 
 		 246 aa  181  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  45.95 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  47.49 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  47.69 
 
 		 251 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  46.82 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  55.05 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  44.39 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  55.91 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  44.86 
 
 		 245 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  40.17 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  47.73 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  47.27 
 
 		 241 aa  161  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  47.27 
 
 		 241 aa  161  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  47.49 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  43.23 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  29.75 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  32.6 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  25.41 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  31.48 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  28.14 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  25 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  29.63 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1716  Conjugal transfer/entry exclusion protein-like protein  23.08 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0193608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5464  hypothetical protein  32.64 
 
 		 291 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0224016 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2845  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.57 
 
 		 251 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13713  normal  0.308482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>