70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1286 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 247 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  95.49 
 
 		 245 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  91.09 
 
 		 247 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  92.41 
 
 		 245 aa  417  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  87.4 
 
 		 242 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  92.86 
 
 		 245 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  83.61 
 
 		 245 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  81.11 
 
 		 241 aa  353  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  79.72 
 
 		 246 aa  350  8.999999999999999e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  72.47 
 
 		 251 aa  348  3e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  71.43 
 
 		 251 aa  345  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  69.72 
 
 		 251 aa  340  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  75.41 
 
 		 241 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  75.41 
 
 		 241 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  75.41 
 
 		 241 aa  337  8e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  75 
 
 		 242 aa  328  6e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  72.27 
 
 		 243 aa  325  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  72.13 
 
 		 241 aa  325  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  63.91 
 
 		 242 aa  287  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  45.73 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  45.23 
 
 		 245 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  45.53 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  48.15 
 
 		 253 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  43.02 
 
 		 259 aa  175  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  43.02 
 
 		 259 aa  175  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  46.37 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  43.6 
 
 		 260 aa  171  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  43.95 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  46.84 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  46.52 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  44.44 
 
 		 244 aa  168  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  40.32 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  43.9 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  45.22 
 
 		 260 aa  162  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  44.21 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  46.12 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  43.57 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  47.54 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  45.95 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  46.08 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  44.04 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  47.77 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  42.92 
 
 		 244 aa  148  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  42.6 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  41.74 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  42.21 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  41.15 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  40.57 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  46.15 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  41.84 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  43.42 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  41.85 
 
 		 239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  42.42 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  41.67 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  30.67 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  33.33 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  33.47 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25.98 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6627  conjugal transfer protein TrbJ  29.57 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331539  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6510  conjugal transfer protein TrbJ  29.57 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225692  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.46 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  31.44 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  31.86 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  22.96 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4266  conjugal transfer protein TrbJ  26.07 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44227  decreased coverage  0.00186593 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1716  Conjugal transfer/entry exclusion protein-like protein  23.47 
 
 		 254 aa  48.5  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0193608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  26.09 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15520  conjugal transfer protein TrbJ  27.09 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120782  unclonable  7.03351e-22 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5610  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  25.15 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>