69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7745 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 254 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  85.66 
 
 		 253 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  84.46 
 
 		 253 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  83.67 
 
 		 253 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  78.71 
 
 		 253 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  75.7 
 
 		 259 aa  351  7e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  75.7 
 
 		 259 aa  351  7e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  81.27 
 
 		 256 aa  339  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  76.86 
 
 		 260 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  69.8 
 
 		 260 aa  328  7e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  69.44 
 
 		 265 aa  320  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  78.31 
 
 		 253 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  69.58 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  73.91 
 
 		 254 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  72.69 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  82.25 
 
 		 252 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  74.88 
 
 		 266 aa  302  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  65.46 
 
 		 244 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  69.55 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  75.11 
 
 		 245 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  71.95 
 
 		 244 aa  278  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  67.87 
 
 		 244 aa  274  9e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  57.92 
 
 		 245 aa  229  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  49.4 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  56.4 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  51.64 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  65.8 
 
 		 243 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  55.05 
 
 		 244 aa  207  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  53.07 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  54.92 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  48.9 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  47.81 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  59.09 
 
 		 240 aa  188  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  54.67 
 
 		 239 aa  185  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  45 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  50.24 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  45.45 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  59.57 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  45.45 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  49.07 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  46.93 
 
 		 242 aa  182  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  49.52 
 
 		 246 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  46.69 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  47.28 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  47.95 
 
 		 243 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  46.69 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  47.32 
 
 		 245 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  50.46 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  42.62 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  49.08 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  49.08 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  46.93 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  46.52 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  43.11 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  29.2 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  25.81 
 
 		 262 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  24.43 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  26.19 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  34.78 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.24 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  33.64 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  30.73 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2504  conjugal transfer protein TrbJ  28.21 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  24.87 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  24.77 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5610  hypothetical protein  46.94 
 
 		 320 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  29.9 
 
 		 237 aa  42.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0761  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.92 
 
 		 258 aa  42  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>