70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4199 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 242 aa  478  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  64.05 
 
 		 241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  62.86 
 
 		 245 aa  298  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  63.64 
 
 		 242 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  67.74 
 
 		 245 aa  294  9e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  61.89 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  62.08 
 
 		 242 aa  288  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  60.17 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  63.3 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  62.81 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  62.81 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  62.4 
 
 		 241 aa  278  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  61.78 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  61.33 
 
 		 251 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  61.33 
 
 		 251 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  61.16 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  62.61 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  64.71 
 
 		 245 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  57.67 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  47.93 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  47.93 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  50.22 
 
 		 253 aa  177  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  40.41 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  43.8 
 
 		 245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  45.87 
 
 		 249 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  41.56 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  48.62 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  42.92 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  46.03 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  48.57 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  48.33 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  43.39 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  45.8 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  43.5 
 
 		 245 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  42.56 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  46.22 
 
 		 258 aa  155  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  47.62 
 
 		 260 aa  154  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  44.87 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  44.63 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  45.07 
 
 		 248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  47.21 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  48.03 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  46.86 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  41.08 
 
 		 244 aa  148  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  44.39 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  45.75 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  42.73 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  40.85 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  46.93 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  38.11 
 
 		 244 aa  131  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  42.66 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  42.08 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  44.92 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  43.13 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  29.79 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.4 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  30.86 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0761  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.02 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  33.33 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  29.59 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  23.47 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4693  P-type conjugative transfer protein TrbJ  24.19 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  24 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  33.67 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1716  Conjugal transfer/entry exclusion protein-like protein  23.68 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0193608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4266  conjugal transfer protein TrbJ  26.79 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44227  decreased coverage  0.00186593 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  25.33 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  24.71 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15520  conjugal transfer protein TrbJ  27 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120782  unclonable  7.03351e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  31.05 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>