68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2828 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 245 aa  478  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  56.79 
 
 		 245 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  61.73 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  57.72 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  57.92 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  59.11 
 
 		 253 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  58.22 
 
 		 253 aa  225  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  54.32 
 
 		 244 aa  224  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  51.43 
 
 		 244 aa  218  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  55.02 
 
 		 259 aa  216  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  55.02 
 
 		 259 aa  216  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  55.16 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  56.94 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  52.65 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  54.55 
 
 		 245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  55.76 
 
 		 254 aa  211  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  52.59 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  60.18 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  60 
 
 		 256 aa  208  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  58.41 
 
 		 253 aa  205  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  50.64 
 
 		 248 aa  205  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  56.68 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  52.65 
 
 		 244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  48.22 
 
 		 265 aa  197  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  46.36 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  51.39 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  60.73 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  52.7 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  62.95 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  48.79 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  51.36 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  54.03 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  57.22 
 
 		 243 aa  175  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  43.5 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  41.87 
 
 		 247 aa  164  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  40.68 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  42.03 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  40.65 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  40.41 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  42.04 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  41.32 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  41.7 
 
 		 242 aa  155  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  41.85 
 
 		 241 aa  154  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  42.22 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  40.91 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  40.89 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  42.08 
 
 		 246 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  41.3 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  40.57 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  38.99 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  40.33 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  40.65 
 
 		 241 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  40.33 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  40.55 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.42 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  34.72 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  29.88 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  30.77 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  32.73 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.63 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15520  conjugal transfer protein TrbJ  29.32 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120782  unclonable  7.03351e-22 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  29.88 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  24.56 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  24.17 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4266  conjugal transfer protein TrbJ  27.51 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44227  decreased coverage  0.00186593 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  24.54 
 
 		 265 aa  42.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  26.35 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.231128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>