70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3695 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 238 aa  464  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  78.67 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  66.67 
 
 		 239 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  59.38 
 
 		 245 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  63.64 
 
 		 254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  60.43 
 
 		 253 aa  234  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  59.47 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  59.47 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  64.62 
 
 		 245 aa  231  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  60.43 
 
 		 253 aa  231  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  64.85 
 
 		 258 aa  230  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  62.74 
 
 		 260 aa  228  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  58.87 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  60.2 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  56.28 
 
 		 244 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  60.85 
 
 		 254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  60.4 
 
 		 244 aa  216  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  57.33 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  54.58 
 
 		 265 aa  215  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  59.48 
 
 		 253 aa  215  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  57.69 
 
 		 253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  53.22 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  64.25 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  60.52 
 
 		 253 aa  208  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  59.39 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  62.5 
 
 		 256 aa  205  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  57.2 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  57 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  61.68 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  49.28 
 
 		 249 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  47.84 
 
 		 248 aa  198  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  60.31 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  55.78 
 
 		 244 aa  178  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  42.15 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  46.05 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  46.05 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  45.61 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  48.06 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  43.75 
 
 		 247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  44.49 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  42.13 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  44.95 
 
 		 241 aa  161  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  45.41 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  42.42 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  45.85 
 
 		 242 aa  155  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  45.1 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  44.83 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  44.28 
 
 		 245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  45.37 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  45.13 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  45.13 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  45.22 
 
 		 245 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  44.69 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  44 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  27.35 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.69 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.22 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  33.68 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  40.79 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  33.64 
 
 		 239 aa  52.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  25.11 
 
 		 269 aa  52  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4748  hypothetical protein  26.85 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.41 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0368  trbJ protein  28.25 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  32.98 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4693  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25.96 
 
 		 252 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  24.9 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  27.8 
 
 		 265 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  26.83 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004336  conjugative transfer protein TrbJ  26.29 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>