66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2610 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 240 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  78.33 
 
 		 238 aa  287  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  65.75 
 
 		 239 aa  239  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  56.71 
 
 		 245 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  61.8 
 
 		 253 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  63.71 
 
 		 258 aa  229  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  61.04 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  57.4 
 
 		 259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  57.4 
 
 		 259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  60.48 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  60 
 
 		 245 aa  219  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  54.89 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  59.03 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  62.38 
 
 		 244 aa  218  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  58.5 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  59.43 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  56.03 
 
 		 260 aa  212  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  57.08 
 
 		 253 aa  208  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  57.76 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  57.08 
 
 		 254 aa  204  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  54.17 
 
 		 265 aa  204  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  50.7 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  59.21 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  54.17 
 
 		 244 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  61.01 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  54.35 
 
 		 244 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  58.7 
 
 		 243 aa  199  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  57.84 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  59.47 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  54.5 
 
 		 248 aa  191  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  47.68 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  58.49 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  54.19 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  43.39 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  42.39 
 
 		 241 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  42.98 
 
 		 251 aa  162  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  43.15 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  46.34 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  44.3 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  45.1 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  45.1 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  42.15 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  44.34 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  44.17 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  44.12 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  42.47 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  45 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  43.56 
 
 		 243 aa  142  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  42.37 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  42.19 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  42.19 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  41.77 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  43.9 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  39.26 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.97 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.87 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  34.83 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  29.63 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  26.44 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4693  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.61 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  31.11 
 
 		 239 aa  45.4  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  23.32 
 
 		 269 aa  45.4  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  36.11 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  30.89 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1716  Conjugal transfer/entry exclusion protein-like protein  25.14 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0193608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4748  hypothetical protein  26.15 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.439827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>