72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2096 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 249 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  52.48 
 
 		 245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  52.48 
 
 		 244 aa  221  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  54.22 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  49.8 
 
 		 259 aa  208  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  49.8 
 
 		 259 aa  208  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  52.68 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  50.39 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  47.76 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  48.99 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  49.79 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  50.4 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  49.54 
 
 		 260 aa  198  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  48.02 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  48.2 
 
 		 244 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  49.55 
 
 		 244 aa  189  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  50.69 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  44.76 
 
 		 260 aa  188  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  47.25 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  43.48 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  51.98 
 
 		 256 aa  185  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  53.1 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  54.42 
 
 		 245 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  46.12 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  45.54 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  48.44 
 
 		 248 aa  178  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  49.38 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  44.75 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  42.04 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  42.28 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  45.13 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  43.57 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  43.93 
 
 		 251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  43.98 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  43.98 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  45.87 
 
 		 242 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  46.94 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  43.89 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  45.68 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  45.54 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  44.44 
 
 		 242 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  46.93 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  44.68 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  44.68 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  45.33 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  40.81 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  39.74 
 
 		 242 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  43.72 
 
 		 243 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  49.77 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  39.11 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  44.02 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  44.21 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  47.37 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  37.76 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  25.97 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5610  hypothetical protein  29.61 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133949  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0368  trbJ protein  26.29 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  23.93 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  30.49 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  33.49 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6505  hypothetical protein  26.61 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  26.7 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  25.89 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  25.58 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1716  Conjugal transfer/entry exclusion protein-like protein  24.14 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0193608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  24.87 
 
 		 250 aa  52  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  23.49 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  24.24 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1521  hypothetical protein  26.36 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  21.52 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5186  type IV secretory pathway, entry exclusion protein A (putative protein precursor)  26.36 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4748  hypothetical protein  27.91 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.439827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>