55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_A3572 on replicon NC_007515
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  100 
 
 		 239 aa  475  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.24 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  33.47 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  32.76 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  31 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  32.46 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  33.78 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  33.18 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1716  Conjugal transfer/entry exclusion protein-like protein  24.53 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0193608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  32.41 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  31.78 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  31.03 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  31.78 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  31.78 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  35.74 
 
 		 242 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  31.78 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  32 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  30.63 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  29.74 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  23.32 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  33.16 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  31.94 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  30.97 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  33.33 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  30.23 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.7 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  29.9 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  31.75 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0761  P-type conjugative transfer protein TrbJ  24.77 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  32.11 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  27.59 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  30.58 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  30.86 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  30.05 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  32.98 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  32.23 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  30 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1720  conjugal transfer protein TrbJ  27.59 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196302  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2233  conjugal transfer protein TrbJ  30.28 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0368  trbJ protein  28.57 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  30.05 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  34.17 
 
 		 240 aa  45.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  27.62 
 
 		 265 aa  45.4  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  31.18 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  29.35 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  31.89 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  32.72 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  29.24 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4693  P-type conjugative transfer protein TrbJ  23.15 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  30.7 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  30 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  26.48 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  25.73 
 
 		 266 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  29.88 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  32.14 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>