14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4748 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4748  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  39.56 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5464  hypothetical protein  27.6 
 
 		 291 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0224016 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5230  hypothetical protein  28.63 
 
 		 259 aa  85.5  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0142717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4259  hypothetical protein  27.41 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5610  hypothetical protein  25.43 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2822  hypothetical protein  20.49 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6505  hypothetical protein  25.23 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  27.42 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  27.91 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1521  hypothetical protein  25.11 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5186  type IV secretory pathway, entry exclusion protein A (putative protein precursor)  25.11 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  26.61 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  26.61 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>