66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0962 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 244 aa  478  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  60.71 
 
 		 245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  54.34 
 
 		 245 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  50 
 
 		 248 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  53.07 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  53.27 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  51.53 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  53.25 
 
 		 253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  51.25 
 
 		 244 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  51.25 
 
 		 253 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  53.95 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  53.7 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  53.7 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  52.05 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  50.93 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  52.84 
 
 		 244 aa  191  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  53.33 
 
 		 245 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  49.37 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  52.08 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  45.54 
 
 		 249 aa  188  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  53.51 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  51.44 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  49.54 
 
 		 245 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  54.11 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  49.15 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  49.53 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  49.53 
 
 		 265 aa  178  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  50.62 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  42.68 
 
 		 242 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  52.04 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  41.67 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  42.97 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  43.35 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  42.92 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  48.99 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  43.18 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  40.51 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  42.53 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  41.47 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  41.1 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  43.12 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  41 
 
 		 251 aa  155  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  41 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  40.18 
 
 		 241 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  41.44 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  56.15 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  51.38 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  42.42 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  42.79 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  42.79 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  55.78 
 
 		 238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  41.59 
 
 		 241 aa  141  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  42.66 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  41.94 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.86 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  31.96 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  32.23 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  25.39 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  26.35 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  25.81 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  24.52 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25.27 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  22.94 
 
 		 265 aa  48.9  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  25.86 
 
 		 266 aa  48.5  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  28.38 
 
 		 261 aa  48.5  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  29.89 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>