42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4749 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4748  hypothetical protein  39.56 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5464  hypothetical protein  32.93 
 
 		 291 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0224016 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4259  hypothetical protein  23.03 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  30.15 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5610  hypothetical protein  26.86 
 
 		 320 aa  52.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  24.04 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  24.66 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  43.64 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2822  hypothetical protein  21.47 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  22.6 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  23.5 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  23.5 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  22.5 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  22.95 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  35.21 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  34.78 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  33.33 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  36.67 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  37.7 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  37.1 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  27.13 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  30.68 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  30.68 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  31.07 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  34.72 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  33.33 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  43.64 
 
 		 248 aa  46.2  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1716  Conjugal transfer/entry exclusion protein-like protein  25 
 
 		 254 aa  45.8  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0193608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  22.82 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  27.27 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  30.85 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  28.36 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  27.18 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  32.84 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  21.18 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  28.83 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  21.35 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  35.48 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  35 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  22.36 
 
 		 251 aa  42  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  32.14 
 
 		 260 aa  42  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>