18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1716 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1716  Conjugal transfer/entry exclusion protein-like protein  100 
 
 		 254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0193608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  50.66 
 
 		 252 aa  221  9e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  24.53 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  23.22 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  23.12 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  23 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  22.92 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  24.56 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4693  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25.24 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  25.66 
 
 		 257 aa  45.4  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  24.43 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  22.78 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  25.27 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  22.81 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  22.81 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  22.54 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  24.21 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  25.15 
 
 		 246 aa  42  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>