75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0434 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 241 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  93.36 
 
 		 241 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  94.14 
 
 		 241 aa  428  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  94.14 
 
 		 241 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  89.21 
 
 		 241 aa  421  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  87.6 
 
 		 242 aa  408  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  91.28 
 
 		 246 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  82.92 
 
 		 251 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  82.92 
 
 		 251 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  79.58 
 
 		 251 aa  380  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  83.13 
 
 		 245 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  73.97 
 
 		 247 aa  354  6.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  72.24 
 
 		 245 aa  354  7.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  72.13 
 
 		 247 aa  348  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  77.98 
 
 		 245 aa  344  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  75.21 
 
 		 242 aa  340  9e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  76.02 
 
 		 245 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  68.06 
 
 		 243 aa  292  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  63.23 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  46.91 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  51.11 
 
 		 253 aa  181  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  48.9 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  48.9 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  43.39 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  45.5 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  50.46 
 
 		 254 aa  175  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  51.11 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  48.9 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  47.41 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  43.81 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  46.67 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  52.19 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  50.7 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  48.39 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  51.16 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  45.49 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  50 
 
 		 253 aa  161  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  47.26 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  44.9 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  47.03 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  44.44 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  44.81 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  46.01 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  49.78 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  44.26 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  45 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  42.22 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  45.22 
 
 		 242 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  47.27 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  41.59 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  42.36 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  42.69 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  45.58 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  42.34 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  30.15 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.88 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  31.36 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  27.74 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  26.97 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  27.15 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  25.62 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.72 
 
 		 250 aa  62  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  33.14 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  26.02 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  26.63 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  22.95 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1716  Conjugal transfer/entry exclusion protein-like protein  26.53 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0193608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0761  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.13 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3193  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.213986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2845  P-type conjugative transfer protein TrbJ  21.31 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13713  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  30.77 
 
 		 240 aa  45.4  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4693  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25.15 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1480  conjugative transposon protein TraI  31.67 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.886511 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0368  trbJ protein  30 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  29.86 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>