75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1320 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 246 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  89.02 
 
 		 245 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  86.9 
 
 		 241 aa  397  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  81.12 
 
 		 251 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  88.61 
 
 		 241 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  88.19 
 
 		 241 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  88.61 
 
 		 241 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  80.32 
 
 		 251 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  79.12 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  84.51 
 
 		 242 aa  384  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  86.81 
 
 		 241 aa  380  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  77.64 
 
 		 245 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  77.82 
 
 		 247 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  76.61 
 
 		 247 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  80.36 
 
 		 245 aa  362  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  72.87 
 
 		 242 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  75.89 
 
 		 245 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  68.52 
 
 		 243 aa  295  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  63.3 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  52.81 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  45.73 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  47.23 
 
 		 245 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  46.06 
 
 		 259 aa  181  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  46.06 
 
 		 259 aa  181  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  44.93 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  47.56 
 
 		 253 aa  178  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  49.55 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  44.8 
 
 		 265 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  48.42 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  44.31 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  47.16 
 
 		 254 aa  171  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  48.92 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  43.81 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  47.6 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  48.03 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  46.58 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  50 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  44.93 
 
 		 244 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  47.47 
 
 		 244 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  47.35 
 
 		 253 aa  158  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  44.44 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  45.83 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  45.9 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  48.5 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  43.59 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  46.49 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  46.63 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  44.75 
 
 		 242 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  40.25 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  41.48 
 
 		 245 aa  138  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  42.93 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  44.09 
 
 		 243 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  45.89 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  44.7 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.94 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.84 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  26.79 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  25 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  32.61 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  27.1 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  33.7 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  25 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25.76 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  24.58 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  23.41 
 
 		 269 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  29.83 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0761  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25.53 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4693  P-type conjugative transfer protein TrbJ  24.39 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  24.22 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2845  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.24 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13713  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1716  Conjugal transfer/entry exclusion protein-like protein  25.5 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0193608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004336  conjugative transfer protein TrbJ  28.69 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  28.33 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3193  P-type conjugative transfer protein TrbJ  24.34 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.213986 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0368  trbJ protein  30.16 
 
 		 263 aa  42  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>