62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2350 on replicon NC_011061
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  100 
 
 		 252 aa  517  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1716  Conjugal transfer/entry exclusion protein-like protein  50.66 
 
 		 254 aa  218  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0193608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  29.22 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  29.95 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  30.94 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  30.86 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  30.86 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  30 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  30.45 
 
 		 241 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  29.46 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4693  P-type conjugative transfer protein TrbJ  23.23 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  28.95 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  28.93 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  28.51 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  29.36 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  27.6 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  25.73 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  30.14 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  29.75 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  29.11 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  27.23 
 
 		 242 aa  62  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  29.35 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  27.54 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  28.45 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  26.67 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  28.95 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  29.17 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  27.04 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  22.61 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  28.02 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  28.02 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  28.07 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  28.89 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  27.59 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  25.84 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  23.56 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  28.51 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  29.88 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  26.57 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  27.16 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  34.09 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  30.39 
 
 		 254 aa  48.9  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  27.15 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2647  conjugal transfer protein TrbJ  26.21 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.783704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  21.1 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  28.92 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  25.73 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  24.22 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  26.69 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  23.24 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  30.85 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  26.24 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  27.5 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0055  conjugal transfer protein TrbJ  30.49 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  28.11 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  25.21 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  30.48 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  27.87 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  25.96 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  25.69 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25.32 
 
 		 250 aa  42.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4228  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  42  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.620306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>