29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2647 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2647  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 264 aa  528  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.783704  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4266  conjugal transfer protein TrbJ  58.43 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44227  decreased coverage  0.00186593 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  57.38 
 
 		 261 aa  260  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6510  conjugal transfer protein TrbJ  57.77 
 
 		 254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225692  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6627  conjugal transfer protein TrbJ  57.77 
 
 		 254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331539  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15520  conjugal transfer protein TrbJ  56.8 
 
 		 261 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120782  unclonable  7.03351e-22 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2233  conjugal transfer protein TrbJ  63.04 
 
 		 257 aa  240  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004336  conjugative transfer protein TrbJ  54.25 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0055  conjugal transfer protein TrbJ  54.58 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1720  conjugal transfer protein TrbJ  55.46 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196302  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  27.27 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  26.27 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  23.51 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  24.62 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  27.81 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4693  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.07 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.36 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0761  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.05 
 
 		 258 aa  52.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  25.69 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.4 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  29.06 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  26.86 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  27.11 
 
 		 241 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  29.15 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  26.72 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  25.65 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4748  hypothetical protein  28.23 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  25.31 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  25 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>