34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2233 on replicon NC_010579
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010579  XfasM23_2233  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 257 aa  512  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2647  conjugal transfer protein TrbJ  60.91 
 
 		 264 aa  256  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.783704  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0055  conjugal transfer protein TrbJ  56.05 
 
 		 258 aa  241  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6510  conjugal transfer protein TrbJ  59.39 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225692  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6627  conjugal transfer protein TrbJ  59.39 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331539  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4266  conjugal transfer protein TrbJ  57.64 
 
 		 254 aa  234  7e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44227  decreased coverage  0.00186593 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  54.11 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15520  conjugal transfer protein TrbJ  56.9 
 
 		 261 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120782  unclonable  7.03351e-22 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1720  conjugal transfer protein TrbJ  51.26 
 
 		 243 aa  212  4.9999999999999996e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196302  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004336  conjugative transfer protein TrbJ  46.77 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  28.44 
 
 		 265 aa  62  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  26.26 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  30.11 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  28.63 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  27.55 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0761  P-type conjugative transfer protein TrbJ  30.95 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  28.63 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  27.2 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  26.11 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  29.21 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.32 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  28.63 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  31.22 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1716  Conjugal transfer/entry exclusion protein-like protein  45.28 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0193608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  32.29 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  26.99 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  27.87 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  29.83 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  25.79 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  28.72 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  28.63 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  28.73 
 
 		 242 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  27.2 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4693  P-type conjugative transfer protein TrbJ  31.82 
 
 		 252 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>