34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4266 on replicon NC_008766
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008766  Ajs_4266  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 
254 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44227  decreased coverage  0.00186593 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6510  conjugal transfer protein TrbJ  91.73 
 
 
254 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225692  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6627  conjugal transfer protein TrbJ  91.73 
 
 
254 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331539  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15520  conjugal transfer protein TrbJ  83.73 
 
 
261 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120782  unclonable  7.03351e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  74.26 
 
 
261 aa  352  2.9999999999999997e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1720  conjugal transfer protein TrbJ  70.94 
 
 
243 aa  310  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196302  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004336  conjugative transfer protein TrbJ  64.11 
 
 
256 aa  291  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2647  conjugal transfer protein TrbJ  58.43 
 
 
264 aa  272  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.783704  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0055  conjugal transfer protein TrbJ  56.86 
 
 
258 aa  251  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2233  conjugal transfer protein TrbJ  57.64 
 
 
257 aa  224  8e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  27.27 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  29.07 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  27.17 
 
 
247 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  28.5 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  25.1 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  27.27 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  25.51 
 
 
269 aa  55.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  26.47 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  29.25 
 
 
252 aa  52.4  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0761  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28.76 
 
 
258 aa  52  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  25.88 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  25.27 
 
 
269 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.6 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  32.69 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5610  hypothetical protein  30.9 
 
 
320 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133949  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  26.34 
 
 
241 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4693  P-type conjugative transfer protein TrbJ  27.31 
 
 
252 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  29.55 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  26.46 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  28.09 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  26.46 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  25.91 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  29.52 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  28.45 
 
 
257 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>