24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_A0055 on replicon NC_009704
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009704  YpsIP31758_A0055  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 258 aa  524  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  58.08 
 
 		 261 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6510  conjugal transfer protein TrbJ  57.54 
 
 		 254 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225692  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6627  conjugal transfer protein TrbJ  57.54 
 
 		 254 aa  258  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331539  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4266  conjugal transfer protein TrbJ  56.86 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44227  decreased coverage  0.00186593 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15520  conjugal transfer protein TrbJ  56.08 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120782  unclonable  7.03351e-22 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004336  conjugative transfer protein TrbJ  52.94 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1720  conjugal transfer protein TrbJ  63 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2647  conjugal transfer protein TrbJ  54.58 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.783704  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2233  conjugal transfer protein TrbJ  56.05 
 
 		 257 aa  224  9e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  28.17 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  27.65 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  28.23 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  27.69 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0761  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.29 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  26.15 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  26.29 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  30.54 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  26.84 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  30.43 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  29.78 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  30.49 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  27.86 
 
 		 245 aa  42  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  28 
 
 		 247 aa  42  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>