31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1720 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1720  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 243 aa  487  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196302  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004336  conjugative transfer protein TrbJ  81.4 
 
 		 256 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  76.85 
 
 		 261 aa  333  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4266  conjugal transfer protein TrbJ  70.94 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44227  decreased coverage  0.00186593 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15520  conjugal transfer protein TrbJ  73.61 
 
 		 261 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120782  unclonable  7.03351e-22 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6510  conjugal transfer protein TrbJ  71.3 
 
 		 254 aa  295  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225692  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6627  conjugal transfer protein TrbJ  71.3 
 
 		 254 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331539  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0055  conjugal transfer protein TrbJ  62.77 
 
 		 258 aa  228  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2647  conjugal transfer protein TrbJ  55.46 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.783704  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2233  conjugal transfer protein TrbJ  51.26 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  27.6 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  28.85 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  26.34 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  28.57 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0761  P-type conjugative transfer protein TrbJ  29.08 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  29.27 
 
 		 242 aa  48.5  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  29.34 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  32.18 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  29.22 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  25.27 
 
 		 269 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  26.4 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  26.4 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1716  Conjugal transfer/entry exclusion protein-like protein  41.51 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0193608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  27.22 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  30.2 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  26.67 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  26.18 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1674  polyketide synthase  34.23 
 
 		 5628 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  29.2 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  27.91 
 
 		 241 aa  42.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4693  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.99 
 
 		 252 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>