37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004336 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004336  conjugative transfer protein TrbJ  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1720  conjugal transfer protein TrbJ  81.4 
 
 		 243 aa  364  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196302  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  68.91 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15520  conjugal transfer protein TrbJ  68.07 
 
 		 261 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120782  unclonable  7.03351e-22 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4266  conjugal transfer protein TrbJ  64.11 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44227  decreased coverage  0.00186593 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6510  conjugal transfer protein TrbJ  63.71 
 
 		 254 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225692  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6627  conjugal transfer protein TrbJ  63.71 
 
 		 254 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2647  conjugal transfer protein TrbJ  54.25 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.783704  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0055  conjugal transfer protein TrbJ  52.94 
 
 		 258 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2233  conjugal transfer protein TrbJ  46.77 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  26.69 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  24.4 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  26.02 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  27.62 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.56 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  23.3 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  28.46 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  26.95 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  26.95 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  25.77 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  28.4 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  30.69 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  25.98 
 
 		 269 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  28.77 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  27.04 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0761  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25 
 
 		 258 aa  48.9  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  26.16 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  26.89 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  26.74 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  29.83 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  28.75 
 
 		 245 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  28.31 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4748  hypothetical protein  30 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  27.27 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  24.81 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1716  Conjugal transfer/entry exclusion protein-like protein  43.18 
 
 		 254 aa  42  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0193608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  26.36 
 
 		 262 aa  42  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>