75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_35680 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 245 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  88.98 
 
 		 245 aa  437  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  89.75 
 
 		 247 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  87.04 
 
 		 247 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  82.59 
 
 		 242 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  83.13 
 
 		 245 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  87.76 
 
 		 245 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  81.57 
 
 		 246 aa  362  4e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  75.1 
 
 		 241 aa  358  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  73.75 
 
 		 251 aa  346  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  71.89 
 
 		 251 aa  345  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  76.73 
 
 		 241 aa  344  7e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  76.54 
 
 		 241 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  76.54 
 
 		 241 aa  340  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  71.25 
 
 		 251 aa  338  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  75.34 
 
 		 242 aa  335  3.9999999999999995e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  73.47 
 
 		 241 aa  329  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  70.45 
 
 		 243 aa  318  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  66.97 
 
 		 242 aa  295  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  46.22 
 
 		 241 aa  197  9e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  45.27 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  48.51 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  44.31 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  44.31 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  47.73 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  43.89 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  46.84 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  45.99 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  45.68 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  42.51 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  48.33 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  45.45 
 
 		 265 aa  161  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  45.64 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  40.76 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  42.98 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  44.81 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  46.61 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  47.13 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  45.66 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  43.64 
 
 		 245 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  47.37 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  47.6 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  41.94 
 
 		 244 aa  149  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  44.09 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  43.57 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  41.74 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  43 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  41.92 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  47.27 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  43.51 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  42.53 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  42.49 
 
 		 239 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  42.13 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  42.86 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  29.74 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  33.7 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  33.63 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  29.21 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  28.51 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  27.94 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15520  conjugal transfer protein TrbJ  27.73 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000120782  unclonable  7.03351e-22 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.04 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4266  conjugal transfer protein TrbJ  25.53 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44227  decreased coverage  0.00186593 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  23.98 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6510  conjugal transfer protein TrbJ  27.54 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225692  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6627  conjugal transfer protein TrbJ  27.54 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331539  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  25.15 
 
 		 269 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  31.86 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0761  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25.93 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5610  hypothetical protein  34.62 
 
 		 320 aa  49.3  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1716  Conjugal transfer/entry exclusion protein-like protein  23.81 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0193608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004336  conjugative transfer protein TrbJ  27 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  24.05 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0368  trbJ protein  30.35 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1720  conjugal transfer protein TrbJ  28.57 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>