65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2882 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 
253 aa  494  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  94.86 
 
 
253 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  86.17 
 
 
253 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  85.66 
 
 
254 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  83.79 
 
 
256 aa  354  8.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  77.87 
 
 
253 aa  352  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  71.94 
 
 
259 aa  343  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  71.94 
 
 
259 aa  343  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  70.31 
 
 
260 aa  331  7.000000000000001e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  70.42 
 
 
245 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  76.42 
 
 
260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  79.52 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  73.53 
 
 
253 aa  317  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  67.33 
 
 
265 aa  313  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  72.22 
 
 
254 aa  311  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  81.36 
 
 
252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  73.49 
 
 
266 aa  299  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  65.46 
 
 
244 aa  292  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  70.67 
 
 
244 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  70 
 
 
245 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  66.67 
 
 
244 aa  266  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  71.49 
 
 
245 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  59.11 
 
 
245 aa  236  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  57.6 
 
 
248 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  52.44 
 
 
248 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  49 
 
 
249 aa  228  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  64.8 
 
 
243 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  56.88 
 
 
244 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  62.9 
 
 
240 aa  202  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  56.43 
 
 
258 aa  202  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  51.67 
 
 
244 aa  201  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  47.9 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  46.37 
 
 
247 aa  199  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  47.11 
 
 
245 aa  197  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  47.74 
 
 
247 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  48.88 
 
 
241 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  56.68 
 
 
239 aa  193  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  48.96 
 
 
251 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  48.96 
 
 
251 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  48.55 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  48.86 
 
 
242 aa  188  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  47.11 
 
 
245 aa  186  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  60.43 
 
 
238 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  48.44 
 
 
245 aa  185  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  50 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  49.28 
 
 
243 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  45.06 
 
 
242 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  42.08 
 
 
241 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  51.16 
 
 
241 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  48.43 
 
 
241 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  48.87 
 
 
241 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  48.87 
 
 
241 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  46.38 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  42.39 
 
 
242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  29.17 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  24.89 
 
 
269 aa  55.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  35.1 
 
 
240 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  23.28 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  30.87 
 
 
237 aa  48.5  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  28 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  24.17 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  37.1 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  32.27 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  24.77 
 
 
250 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5464  hypothetical protein  27.39 
 
 
291 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0224016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>