70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3090 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 253 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  81.58 
 
 		 254 aa  350  8.999999999999999e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  79.52 
 
 		 253 aa  350  8.999999999999999e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  78.31 
 
 		 253 aa  342  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  88.49 
 
 		 252 aa  341  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  77.29 
 
 		 253 aa  341  5.999999999999999e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  76.31 
 
 		 253 aa  336  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  70.68 
 
 		 259 aa  330  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  70.68 
 
 		 259 aa  330  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  68.65 
 
 		 260 aa  323  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  73.8 
 
 		 260 aa  318  6e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  79.52 
 
 		 256 aa  315  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  71.98 
 
 		 254 aa  311  5.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  71.97 
 
 		 253 aa  311  9e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  68.49 
 
 		 245 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  66 
 
 		 265 aa  307  9e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  71.03 
 
 		 266 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  66.94 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  66.39 
 
 		 244 aa  278  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  67.42 
 
 		 245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  72.77 
 
 		 245 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  68.6 
 
 		 244 aa  265  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  58.41 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  51.81 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  61.43 
 
 		 248 aa  225  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  52.7 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  55.05 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  59.4 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  52.08 
 
 		 244 aa  208  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  49.79 
 
 		 241 aa  201  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  60.19 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  47.01 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  61.14 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  45.95 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  56 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  45.82 
 
 		 242 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  45.42 
 
 		 245 aa  191  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  48.21 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  49.58 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  49.33 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  48.09 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  47.13 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  48.66 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  49.55 
 
 		 243 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  47.35 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  54.37 
 
 		 239 aa  186  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  50 
 
 		 241 aa  184  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  48.81 
 
 		 241 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  48.19 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  48.19 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  46.98 
 
 		 245 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  46.56 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  41.98 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  42.21 
 
 		 242 aa  135  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  29.32 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  29.02 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  27.24 
 
 		 266 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5380  conjugal transfer protein TrbJ  26.17 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  25.6 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  37.38 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  29.78 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1616  P-type conjugative transfer protein TrbJ  25.15 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4565  conjugal transfer protein TrbJ  29.45 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30666  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5610  hypothetical protein  40.85 
 
 		 320 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  31.88 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.07 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1521  hypothetical protein  34.25 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5186  type IV secretory pathway, entry exclusion protein A (putative protein precursor)  34.25 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  32.93 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  25.26 
 
 		 269 aa  42.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>