More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5141 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 417 aa  830    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  72.55 
 
 		 398 aa  535  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  49.65 
 
 		 414 aa  346  4e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  48.87 
 
 		 347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  47.69 
 
 		 390 aa  299  6e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  46.9 
 
 		 394 aa  295  7e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  48.16 
 
 		 394 aa  292  7e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  45.21 
 
 		 422 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  48.16 
 
 		 358 aa  287  2.9999999999999996e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  40.95 
 
 		 417 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  40.95 
 
 		 417 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  40.95 
 
 		 417 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  40.72 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  42.22 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  43.65 
 
 		 389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  45.05 
 
 		 453 aa  282  7.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  45.19 
 
 		 432 aa  279  6e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  45.87 
 
 		 423 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  50.65 
 
 		 326 aa  277  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  46.24 
 
 		 442 aa  276  4e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  43.1 
 
 		 412 aa  276  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  44.76 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  44.6 
 
 		 421 aa  272  8.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  45.4 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  48.29 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  47.22 
 
 		 330 aa  263  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  47.78 
 
 		 406 aa  263  4.999999999999999e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  44.9 
 
 		 414 aa  259  7e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  47.17 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  41.96 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  42.32 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  42.68 
 
 		 349 aa  242  9e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  46.91 
 
 		 374 aa  239  6.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  43.57 
 
 		 363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  40.42 
 
 		 346 aa  225  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  37.58 
 
 		 977 aa  209  9e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  35.16 
 
 		 989 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  35.12 
 
 		 303 aa  186  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  40.39 
 
 		 855 aa  183  6e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  33.11 
 
 		 280 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  37.05 
 
 		 900 aa  178  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  33.68 
 
 		 286 aa  172  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  36.18 
 
 		 759 aa  169  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  36 
 
 		 293 aa  168  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  36.69 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  34.13 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  33 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  36.64 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  33.54 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  30.79 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  34.63 
 
 		 740 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  28.62 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  31.8 
 
 		 310 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.99 
 
 		 1055 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.67 
 
 		 911 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  31.63 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  33.44 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  33.98 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  30.41 
 
 		 735 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  33.12 
 
 		 302 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  33.33 
 
 		 298 aa  143  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  31.38 
 
 		 308 aa  143  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  31.58 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  31.54 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  31.58 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  31.58 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  31.27 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  33.66 
 
 		 311 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  33.71 
 
 		 310 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  33.33 
 
 		 311 aa  139  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0013  preprotein translocase subunit SecF  34.41 
 
 		 311 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000001158  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  33.22 
 
 		 293 aa  139  8.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  33.86 
 
 		 310 aa  139  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1107  preprotein translocase subunit SecF  32.57 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0908186  normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  32.44 
 
 		 303 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  32.56 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  27.36 
 
 		 302 aa  138  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.77 
 
 		 762 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  32.47 
 
 		 328 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  32.56 
 
 		 302 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  32.44 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.75 
 
 		 991 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1278  preprotein translocase subunit SecF  31.91 
 
 		 414 aa  136  9e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000278006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  33.01 
 
 		 311 aa  136  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0540  preprotein translocase subunit SecF  30.83 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0258314 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  31.61 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  32.76 
 
 		 761 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  32.77 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  31.13 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  31.6 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  31.61 
 
 		 316 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  30.1 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  31.25 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  29.9 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.38 
 
 		 750 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.39 
 
 		 996 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  30.91 
 
 		 302 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1695  preprotein translocase subunit SecF  31.51 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  30.36 
 
 		 315 aa  133  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>