More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1770 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 
307 aa  604  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  43.11 
 
 
307 aa  238  8e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  41.08 
 
 
322 aa  233  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  44.41 
 
 
313 aa  229  4e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  41.98 
 
 
293 aa  228  8e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  43.96 
 
 
315 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  41.75 
 
 
313 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  39.8 
 
 
311 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  41.81 
 
 
311 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  39.26 
 
 
323 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  39.26 
 
 
323 aa  223  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  39.26 
 
 
323 aa  223  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  39.26 
 
 
323 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  39.26 
 
 
323 aa  223  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  41.14 
 
 
315 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  39.26 
 
 
323 aa  223  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  39.26 
 
 
323 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  39.26 
 
 
323 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  39.26 
 
 
323 aa  223  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  39.72 
 
 
357 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  44.37 
 
 
316 aa  222  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  42.2 
 
 
310 aa  219  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  42.35 
 
 
304 aa  219  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  40.74 
 
 
322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  40.74 
 
 
322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  40.74 
 
 
322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  40.55 
 
 
286 aa  219  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  38 
 
 
311 aa  219  6e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  43.62 
 
 
315 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  40.47 
 
 
314 aa  218  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  41.14 
 
 
315 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  38.93 
 
 
323 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  38.93 
 
 
323 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  38.93 
 
 
323 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  38.93 
 
 
323 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  38.93 
 
 
323 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  37.34 
 
 
337 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  43.73 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  37.34 
 
 
316 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  40.2 
 
 
315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  42.7 
 
 
312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  39.86 
 
 
338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  39.38 
 
 
309 aa  212  4.9999999999999996e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  40.07 
 
 
323 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  38.08 
 
 
309 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  38.36 
 
 
308 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  43.16 
 
 
316 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  40.67 
 
 
315 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  38.44 
 
 
316 aa  209  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  37.9 
 
 
323 aa  210  3e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  37.9 
 
 
323 aa  210  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  36.58 
 
 
323 aa  209  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  41.95 
 
 
312 aa  209  7e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  40.07 
 
 
323 aa  209  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  41.61 
 
 
315 aa  208  9e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  40.14 
 
 
314 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  38.97 
 
 
323 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  38.61 
 
 
310 aa  207  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4004  preprotein translocase subunit SecF  36.12 
 
 
317 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.833906 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  37.21 
 
 
323 aa  206  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  39.53 
 
 
302 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  38.38 
 
 
296 aa  206  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3354  preprotein translocase subunit SecF  35.79 
 
 
317 aa  205  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  40.33 
 
 
315 aa  205  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  40.28 
 
 
323 aa  205  8e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  38.59 
 
 
323 aa  204  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  35.4 
 
 
321 aa  204  1e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  36.57 
 
 
311 aa  203  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0847  protein-export membrane protein SecF  38.21 
 
 
359 aa  203  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0561071  normal  0.116765 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  39.13 
 
 
313 aa  202  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  35.46 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  37.09 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  38.27 
 
 
302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  37.18 
 
 
302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  37.02 
 
 
301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  36.82 
 
 
303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  37.63 
 
 
323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  37.91 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  36.64 
 
 
322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  36.49 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0034  preprotein translocase subunit SecF  36.89 
 
 
311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  35.46 
 
 
316 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0682  protein-export membrane protein SecF  35.56 
 
 
357 aa  200  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4643  preprotein translocase subunit SecF  34.78 
 
 
317 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410756  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  36.42 
 
 
323 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  35.46 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  38.05 
 
 
304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  35.46 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  38.05 
 
 
304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  37.06 
 
 
310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  36.99 
 
 
291 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  37.12 
 
 
310 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1022  preprotein translocase subunit SecF  38.38 
 
 
324 aa  199  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  40.2 
 
 
323 aa  199  6e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3288  preprotein translocase subunit SecF  37.71 
 
 
322 aa  199  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  37.23 
 
 
316 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  36.82 
 
 
303 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  37.33 
 
 
293 aa  198  9e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  39.6 
 
 
315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0837  preprotein translocase subunit SecF  36.9 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>