More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2060 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 326 aa  624  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  68.39 
 
 		 347 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  64.51 
 
 		 390 aa  401  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  53.05 
 
 		 414 aa  318  6e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  51.78 
 
 		 398 aa  285  5e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  50.65 
 
 		 417 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  52.96 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  48.22 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  47.51 
 
 		 366 aa  268  8.999999999999999e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  43.88 
 
 		 422 aa  266  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  54.05 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  47.98 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  50.34 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  46.96 
 
 		 389 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  49.2 
 
 		 406 aa  260  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  44.07 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  43.11 
 
 		 423 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  45.75 
 
 		 412 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  43.24 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  44.41 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  48.01 
 
 		 453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  41.84 
 
 		 417 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  41.84 
 
 		 417 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  41.84 
 
 		 417 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  41.99 
 
 		 338 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  44.91 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  44.83 
 
 		 374 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  44.05 
 
 		 442 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  41.56 
 
 		 340 aa  241  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  46 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  42.64 
 
 		 396 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  41.98 
 
 		 349 aa  235  8e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  43.32 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  44.9 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  44.56 
 
 		 363 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  38.38 
 
 		 900 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  36.03 
 
 		 977 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  40.59 
 
 		 855 aa  180  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  32.89 
 
 		 989 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  36.64 
 
 		 761 aa  169  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  32.3 
 
 		 286 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  34.3 
 
 		 296 aa  159  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  33.74 
 
 		 759 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  30.9 
 
 		 280 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  28.24 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.06 
 
 		 911 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  28.75 
 
 		 307 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  36.25 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  32.66 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  31.29 
 
 		 310 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  34.95 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  34.56 
 
 		 748 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.08 
 
 		 856 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  34.85 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  34.47 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  34.47 
 
 		 337 aa  136  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  29.26 
 
 		 307 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  30 
 
 		 740 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  31.37 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  32.8 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.06 
 
 		 762 aa  133  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  28.48 
 
 		 735 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  35.1 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  30.16 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.93 
 
 		 750 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  28.81 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  31.61 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  30.48 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  31.21 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  28.62 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  32.84 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  27.97 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  26.03 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  27.47 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  27.51 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  32.38 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  32.38 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  32.38 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  32.78 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  32.82 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  29.08 
 
 		 302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  31.33 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  25.68 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  30.89 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4643  preprotein translocase subunit SecF  31.49 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  32.46 
 
 		 310 aa  126  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  34 
 
 		 315 aa  126  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  30.97 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.54 
 
 		 750 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  31.8 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  30.85 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  32.29 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4405  preprotein translocase subunit SecF  32.23 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0338927  normal  0.256135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  32.61 
 
 		 1029 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  28.28 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  33.45 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  30.52 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  27.41 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  31.02 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>