More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0626 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 310 aa  622  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  41.04 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  41.18 
 
 		 289 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  42.61 
 
 		 280 aa  222  6e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  40.85 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  40.89 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  43.23 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  42.62 
 
 		 292 aa  215  7e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  38.83 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0537  protein-export membrane protein SecF  36.86 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416815  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  34.98 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  39.25 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  36.31 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  36.84 
 
 		 735 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  39.46 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1286  protein-export membrane protein SecF  39.38 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  37.54 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  37.54 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  34.87 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  37.25 
 
 		 321 aa  186  4e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  35.5 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  35.74 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  35.29 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1408  protein translocase subunit secF  35.91 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  35.67 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  35.29 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  36.89 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  36.27 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.95 
 
 		 750 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  36.71 
 
 		 338 aa  179  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  36.24 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.21 
 
 		 752 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  36.76 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.13 
 
 		 991 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  34.63 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  34.92 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.38 
 
 		 750 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  31.09 
 
 		 759 aa  176  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.21 
 
 		 755 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  34.2 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  31.92 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  35.84 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  37.11 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  36.42 
 
 		 311 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  33.02 
 
 		 1001 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  32.59 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  32.59 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1603  protein-export membrane protein SecF  34.23 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.232098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  33.9 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  37.19 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.33 
 
 		 1055 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  35.14 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  32.78 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  32.26 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  34.3 
 
 		 301 aa  172  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 310 aa  172  9e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  34.38 
 
 		 315 aa  172  9e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  32.15 
 
 		 989 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  33.67 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  32.49 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  33.78 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.12 
 
 		 754 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.25 
 
 		 759 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.5 
 
 		 995 aa  170  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  35.16 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.25 
 
 		 759 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  32.44 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.1 
 
 		 754 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  37.8 
 
 		 316 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.1 
 
 		 754 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  31.6 
 
 		 307 aa  170  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2101  protein-export membrane protein SecF  34.32 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  34.84 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  33.99 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.1 
 
 		 754 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  36.69 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  33.11 
 
 		 302 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0034  preprotein translocase subunit SecF  35.78 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.77 
 
 		 754 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.77 
 
 		 754 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  34.39 
 
 		 323 aa  169  8e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  34.39 
 
 		 323 aa  169  8e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.55 
 
 		 754 aa  169  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  34.48 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  32.05 
 
 		 761 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  33.22 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  35.42 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  33.98 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.77 
 
 		 754 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.77 
 
 		 754 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  35.48 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  31.4 
 
 		 357 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  34.31 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  32.47 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0066  protein-export membrane protein SecF  34.78 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.85 
 
 		 856 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  32.79 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  32.78 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>