More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2101 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2101  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 
308 aa  615  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.84 
 
 
750 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43 
 
 
750 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.74 
 
 
759 aa  219  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.74 
 
 
759 aa  219  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.85 
 
 
754 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.25 
 
 
754 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.25 
 
 
754 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.25 
 
 
754 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.25 
 
 
754 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.25 
 
 
754 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.25 
 
 
754 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.91 
 
 
754 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.25 
 
 
754 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  40.55 
 
 
286 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.19 
 
 
755 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  41.14 
 
 
296 aa  208  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.51 
 
 
752 aa  201  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.54 
 
 
763 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  40.8 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  40.21 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  37.75 
 
 
735 aa  192  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  36.55 
 
 
989 aa  186  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  39.02 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  40.28 
 
 
293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  40.91 
 
 
292 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  34.32 
 
 
310 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  32.24 
 
 
307 aa  180  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  36.03 
 
 
302 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  37.38 
 
 
317 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  36.83 
 
 
322 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  32.54 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  34.47 
 
 
311 aa  172  9e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  36.45 
 
 
309 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  36.15 
 
 
321 aa  171  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 
307 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  35.32 
 
 
307 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  35.27 
 
 
311 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  39.23 
 
 
308 aa  168  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  35.55 
 
 
302 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0013  preprotein translocase subunit SecF  35.14 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000001158  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  35.09 
 
 
304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  35.09 
 
 
304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.42 
 
 
996 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  34.46 
 
 
313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0537  protein-export membrane protein SecF  31.99 
 
 
327 aa  165  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416815  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  34.65 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  31.67 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  31.86 
 
 
301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  33.11 
 
 
308 aa  162  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  35.14 
 
 
302 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  31.66 
 
 
357 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  33.77 
 
 
316 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  31.77 
 
 
301 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  33.99 
 
 
337 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  34.59 
 
 
315 aa  159  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  34.77 
 
 
323 aa  159  8e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  37.19 
 
 
314 aa  159  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1799  preprotein translocase subunit SecF  39.8 
 
 
324 aa  158  9e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0457  preprotein translocase subunit SecF  39.8 
 
 
324 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0172615  normal  0.0827508 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  34.41 
 
 
323 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  35.31 
 
 
315 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  36.64 
 
 
315 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  34.41 
 
 
323 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0445  preprotein translocase subunit SecF  39.8 
 
 
324 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  33.95 
 
 
323 aa  158  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  37.41 
 
 
323 aa  157  2e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  36.03 
 
 
289 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1415  preprotein translocase subunit SecF  35.58 
 
 
330 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661465  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  32.43 
 
 
977 aa  156  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.06 
 
 
991 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  32.5 
 
 
318 aa  155  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  31.83 
 
 
310 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 
305 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.82 
 
 
759 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  36.18 
 
 
289 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  31.73 
 
 
328 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  33.22 
 
 
740 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0147  protein translocase subunit secF  41.88 
 
 
404 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000009249  hitchhiker  0.00252765 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0034  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 
311 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  36.43 
 
 
315 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  32.98 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2889  preprotein translocase subunit SecF  38.64 
 
 
315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000629469 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.58 
 
 
856 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.46 
 
 
846 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  35.79 
 
 
313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1047  preprotein translocase subunit SecF  36.27 
 
 
323 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  30.33 
 
 
302 aa  151  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  32.28 
 
 
325 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  37.07 
 
 
312 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0504  preprotein translocase subunit SecF  34.87 
 
 
313 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  32.62 
 
 
313 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3983  protein-export membrane protein SecF  35.16 
 
 
324 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586193  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_002936  DET0332  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 
301 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.496269  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  35.62 
 
 
315 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  35.71 
 
 
328 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.33 
 
 
762 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  34.25 
 
 
315 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  35.62 
 
 
315 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  35.4 
 
 
315 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>