More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1936 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 
759 aa  1504    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  48.93 
 
 
762 aa  643    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  70.43 
 
 
740 aa  988    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.88 
 
 
856 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.26 
 
 
856 aa  425  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  33.73 
 
 
735 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.71 
 
 
849 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.52 
 
 
848 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.05 
 
 
853 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  32.47 
 
 
849 aa  378  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.24 
 
 
839 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.39 
 
 
845 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  34.21 
 
 
843 aa  375  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.12 
 
 
844 aa  376  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.24 
 
 
844 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.06 
 
 
834 aa  365  1e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  36.27 
 
 
1029 aa  364  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.23 
 
 
844 aa  360  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  33.16 
 
 
761 aa  360  6e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.16 
 
 
1055 aa  360  7e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.3 
 
 
846 aa  356  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  35.39 
 
 
989 aa  355  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.06 
 
 
995 aa  349  1e-94  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.99 
 
 
846 aa  347  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.47 
 
 
996 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  31.78 
 
 
855 aa  333  6e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.07 
 
 
995 aa  330  4e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  34 
 
 
748 aa  330  8e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.25 
 
 
759 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.25 
 
 
785 aa  329  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.87 
 
 
991 aa  329  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.25 
 
 
785 aa  329  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.65 
 
 
981 aa  328  2.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  33.28 
 
 
1001 aa  328  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.72 
 
 
755 aa  327  7e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1501  protein-export membrane protein SecD  33.88 
 
 
793 aa  327  7e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.365573  normal  0.0601553 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.15 
 
 
754 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.06 
 
 
754 aa  325  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.93 
 
 
754 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.06 
 
 
754 aa  324  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.72 
 
 
750 aa  323  7e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.8 
 
 
754 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.67 
 
 
754 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.8 
 
 
754 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.67 
 
 
754 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.54 
 
 
754 aa  320  9e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.07 
 
 
752 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.35 
 
 
750 aa  317  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.68 
 
 
756 aa  317  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.92 
 
 
763 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  46.21 
 
 
530 aa  312  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.84 
 
 
990 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.63 
 
 
759 aa  310  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.63 
 
 
759 aa  310  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  43.96 
 
 
457 aa  303  7.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.93 
 
 
991 aa  301  4e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  41.13 
 
 
533 aa  298  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  42.33 
 
 
531 aa  298  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  39.95 
 
 
416 aa  298  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1073  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.45 
 
 
753 aa  292  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0361267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  38.97 
 
 
530 aa  291  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  42.04 
 
 
532 aa  289  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  41.34 
 
 
525 aa  289  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  41.04 
 
 
399 aa  289  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  44.33 
 
 
533 aa  287  5e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  38.16 
 
 
532 aa  286  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  39.37 
 
 
413 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  42.86 
 
 
526 aa  284  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  40.25 
 
 
533 aa  284  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  43.95 
 
 
532 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  39.85 
 
 
533 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  39.13 
 
 
532 aa  283  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  39.9 
 
 
530 aa  282  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  42.07 
 
 
464 aa  281  4e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  41.52 
 
 
594 aa  281  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  41.52 
 
 
594 aa  281  4e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  41.65 
 
 
535 aa  280  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.71 
 
 
858 aa  280  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  41.76 
 
 
531 aa  278  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  29.78 
 
 
734 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  39.76 
 
 
406 aa  274  6e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  39.62 
 
 
533 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  41.48 
 
 
554 aa  272  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  39.12 
 
 
533 aa  271  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  41.65 
 
 
470 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  41.65 
 
 
470 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  40.73 
 
 
533 aa  268  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  38.24 
 
 
411 aa  267  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  38.73 
 
 
410 aa  266  8e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  41.64 
 
 
534 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  41.37 
 
 
554 aa  266  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  38.76 
 
 
470 aa  266  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  39.67 
 
 
461 aa  266  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  41.16 
 
 
554 aa  265  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  41.16 
 
 
554 aa  265  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  36.96 
 
 
403 aa  265  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  40.27 
 
 
532 aa  264  6e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  40.82 
 
 
533 aa  264  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  37.71 
 
 
534 aa  262  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  41.69 
 
 
532 aa  262  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>