More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1929 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  66.73 
 
 		 532 aa  701    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  59.74 
 
 		 530 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 526 aa  1045    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  66.16 
 
 		 532 aa  703    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  58.78 
 
 		 533 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  57.85 
 
 		 531 aa  593  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  50.09 
 
 		 533 aa  473  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  45.76 
 
 		 533 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  46.1 
 
 		 530 aa  465  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  45.76 
 
 		 532 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  45.57 
 
 		 533 aa  451  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  44.32 
 
 		 530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  44.82 
 
 		 532 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  48.59 
 
 		 533 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  47.98 
 
 		 524 aa  435  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  45.39 
 
 		 533 aa  428  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  42.78 
 
 		 534 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  45.2 
 
 		 525 aa  418  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  42.75 
 
 		 535 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  41.6 
 
 		 632 aa  364  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  41.76 
 
 		 632 aa  363  6e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.48 
 
 		 853 aa  361  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  41.57 
 
 		 632 aa  361  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  42.33 
 
 		 594 aa  360  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  42.33 
 
 		 594 aa  360  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  42.89 
 
 		 521 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  42.17 
 
 		 531 aa  358  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  39.34 
 
 		 533 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  41.98 
 
 		 529 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.04 
 
 		 856 aa  355  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  39.41 
 
 		 532 aa  354  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  41.65 
 
 		 526 aa  353  4e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  42.71 
 
 		 625 aa  352  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  42.54 
 
 		 640 aa  351  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  41.33 
 
 		 526 aa  350  3e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  41.57 
 
 		 521 aa  349  6e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  38.99 
 
 		 554 aa  349  7e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  43.03 
 
 		 510 aa  348  1e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  38.8 
 
 		 533 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.13 
 
 		 844 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  39.78 
 
 		 533 aa  347  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  39.67 
 
 		 534 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  40.62 
 
 		 636 aa  344  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  43.5 
 
 		 604 aa  345  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  39.28 
 
 		 533 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.1 
 
 		 839 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  39.6 
 
 		 532 aa  343  5e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3866  preprotein translocase subunit SecD  42.08 
 
 		 626 aa  343  5e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  39.88 
 
 		 554 aa  343  5e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.01 
 
 		 848 aa  342  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  40.71 
 
 		 535 aa  342  9e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  38.56 
 
 		 522 aa  342  1e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2427  preprotein translocase subunit SecD  42.65 
 
 		 614 aa  341  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  39.64 
 
 		 533 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  39.25 
 
 		 512 aa  340  4e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  41.55 
 
 		 554 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  39.03 
 
 		 532 aa  337  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  43.04 
 
 		 621 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.03 
 
 		 849 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  41.04 
 
 		 554 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  41.04 
 
 		 554 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.3 
 
 		 834 aa  336  5.999999999999999e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.87 
 
 		 845 aa  336  7e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1236  preprotein translocase subunit SecD  41.59 
 
 		 526 aa  335  9e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.543695  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1111  preprotein translocase subunit SecD  41.78 
 
 		 526 aa  335  1e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.789718  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.33 
 
 		 856 aa  335  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  38.56 
 
 		 535 aa  335  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.68 
 
 		 844 aa  333  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0630  preprotein translocase subunit SecD  41.52 
 
 		 526 aa  333  4e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  38.97 
 
 		 533 aa  333  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0344  preprotein translocase subunit SecD  41.15 
 
 		 633 aa  332  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  39.45 
 
 		 534 aa  330  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.39 
 
 		 844 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  37.61 
 
 		 551 aa  327  3e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  38.56 
 
 		 532 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  38.72 
 
 		 531 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  38.56 
 
 		 532 aa  325  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  41.05 
 
 		 554 aa  325  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  40.8 
 
 		 609 aa  324  3e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0277  preprotein translocase subunit SecD  39.64 
 
 		 626 aa  324  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2835  preprotein translocase subunit SecD  39.25 
 
 		 616 aa  323  4e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2350  preprotein translocase subunit SecD  41.21 
 
 		 618 aa  322  9.000000000000001e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.951904  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  39.53 
 
 		 534 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  39.12 
 
 		 534 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0146  protein-export membrane protein SecD  39.48 
 
 		 535 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00836416  hitchhiker  0.00269224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1323  protein-export membrane protein SecD  36.24 
 
 		 611 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.970602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5119  preprotein translocase subunit SecD  40.04 
 
 		 627 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  38.35 
 
 		 537 aa  318  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1303  protein-export membrane protein SecD  40.78 
 
 		 622 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  39.74 
 
 		 623 aa  317  5e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  38.92 
 
 		 556 aa  314  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  38.65 
 
 		 614 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  38.4 
 
 		 595 aa  312  7.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1437  preprotein translocase subunit SecD  39.45 
 
 		 616 aa  310  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013441  hitchhiker  0.000143717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1449  preprotein translocase subunit SecD  39.26 
 
 		 616 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00202636  normal  0.0146122 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1407  secretion protein SecD  38.51 
 
 		 622 aa  306  5.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0970542  normal  0.495357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  37.91 
 
 		 621 aa  306  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2959  preprotein translocase subunit SecD  39 
 
 		 629 aa  306  6e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  46.47 
 
 		 457 aa  306  7e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3885  preprotein translocase subunit SecD  38.93 
 
 		 625 aa  306  8.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>