More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1323 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  75.12 
 
 
613 aa  945    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  74.92 
 
 
613 aa  942    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1323  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 
611 aa  1237    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.970602  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  75.28 
 
 
613 aa  947    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  38.11 
 
 
530 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  35.9 
 
 
532 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  36.38 
 
 
605 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  36.83 
 
 
595 aa  326  7e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  36.12 
 
 
594 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  36.11 
 
 
619 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  36.24 
 
 
526 aa  317  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  35.87 
 
 
607 aa  317  4e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  35.69 
 
 
531 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2396  protein-export membrane protein SecD  34.21 
 
 
637 aa  307  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564509  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0013  preprotein translocase subunit SecD  35.69 
 
 
624 aa  306  8.000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295061  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  33.81 
 
 
638 aa  306  9.000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  34.72 
 
 
532 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  35.26 
 
 
622 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  34.96 
 
 
530 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  35.44 
 
 
533 aa  303  7.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  33.66 
 
 
531 aa  303  8.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  33.98 
 
 
530 aa  303  8.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  33.17 
 
 
535 aa  303  9e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  35.1 
 
 
533 aa  295  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2959  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 
629 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2715  preprotein translocase subunit SecD  35.51 
 
 
626 aa  294  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.177706 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  32.75 
 
 
533 aa  293  9e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2549  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 
629 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370381  normal  0.188242 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  33.75 
 
 
532 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  34.81 
 
 
594 aa  291  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  34.81 
 
 
594 aa  291  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  33.09 
 
 
512 aa  289  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  33.01 
 
 
534 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  37.32 
 
 
533 aa  286  9e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  32.22 
 
 
533 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  32.37 
 
 
533 aa  281  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1218  preprotein translocase subunit SecD  35.78 
 
 
621 aa  276  6e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.518755 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  38.37 
 
 
473 aa  276  7e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  33.63 
 
 
526 aa  276  9e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  35.79 
 
 
524 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1240  protein translocase subunit  33.1 
 
 
622 aa  273  9e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00253338  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1291  protein-export membrane protein SecD  33.1 
 
 
622 aa  272  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.00000000000000635694  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  31.19 
 
 
521 aa  269  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  32.13 
 
 
529 aa  268  2e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  34.97 
 
 
640 aa  267  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004365  protein-export membrane protein SecD  33.51 
 
 
607 aa  261  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59973  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01048  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 
607 aa  259  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  50 
 
 
525 aa  259  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0878  preprotein translocase subunit SecD  31.56 
 
 
620 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16793 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00522  preprotein translocase subunit SecD  32.22 
 
 
614 aa  256  7e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0630  preprotein translocase subunit SecD  31.57 
 
 
526 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1982  preprotein translocase subunit SecD  33.39 
 
 
618 aa  254  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3866  preprotein translocase subunit SecD  33.64 
 
 
626 aa  253  6e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1977  preprotein translocase subunit SecD  33.39 
 
 
618 aa  253  9.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.38 
 
 
981 aa  250  6e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.05 
 
 
995 aa  250  6e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  40 
 
 
457 aa  250  6e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  39.14 
 
 
532 aa  249  8e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  32.33 
 
 
532 aa  249  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  35.08 
 
 
623 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.86 
 
 
991 aa  249  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  30.76 
 
 
532 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  32.03 
 
 
554 aa  247  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40460  preprotein translocase subunit SecD  32.44 
 
 
622 aa  247  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  32.55 
 
 
614 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  36.42 
 
 
470 aa  245  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  38.79 
 
 
464 aa  242  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  45.23 
 
 
526 aa  242  1e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  44.14 
 
 
1029 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  31.27 
 
 
533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  45.95 
 
 
843 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  44.04 
 
 
403 aa  240  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  31.82 
 
 
554 aa  240  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  36.07 
 
 
474 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  37.84 
 
 
471 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  44.75 
 
 
554 aa  239  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  32.47 
 
 
537 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0865  preprotein translocase subunit SecD  32.26 
 
 
620 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0679979  normal  0.748339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0835  preprotein translocase subunit SecD  32.44 
 
 
620 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.707354  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2184  protein-export membrane protein SecD  34.67 
 
 
620 aa  238  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2835  preprotein translocase subunit SecD  31.72 
 
 
616 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  30.9 
 
 
535 aa  236  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.93 
 
 
995 aa  236  9e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.02 
 
 
990 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  41.98 
 
 
533 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  44.33 
 
 
510 aa  233  5e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  44.84 
 
 
554 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  44.84 
 
 
554 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1122  preprotein translocase subunit SecD  47.37 
 
 
615 aa  233  9e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276034  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  43.31 
 
 
521 aa  233  9e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.99 
 
 
849 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  45.2 
 
 
625 aa  232  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  43.21 
 
 
534 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0877  preprotein translocase subunit SecD  31.52 
 
 
615 aa  232  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  47.06 
 
 
856 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  43.06 
 
 
406 aa  230  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  40.99 
 
 
554 aa  230  6e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0681  preprotein translocase subunit SecD  32.14 
 
 
587 aa  229  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2527  preprotein translocase subunit SecD  44.6 
 
 
681 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  32.34 
 
 
609 aa  229  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>