More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0854 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  79.85 
 
 		 532 aa  875    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  87.24 
 
 		 533 aa  954    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  81.99 
 
 		 533 aa  913    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 533 aa  1066    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  75.05 
 
 		 530 aa  822    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  72.47 
 
 		 534 aa  779    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  79.85 
 
 		 532 aa  878    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  74.48 
 
 		 530 aa  824    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  55.51 
 
 		 533 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  52.08 
 
 		 533 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  51.98 
 
 		 524 aa  514  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  47.43 
 
 		 531 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  45.51 
 
 		 530 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  45.52 
 
 		 532 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  45.34 
 
 		 525 aa  457  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  46.96 
 
 		 533 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  44.73 
 
 		 532 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  45.39 
 
 		 526 aa  428  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  43.39 
 
 		 594 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  43.39 
 
 		 594 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  42.5 
 
 		 534 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  42.13 
 
 		 533 aa  398  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  41.25 
 
 		 535 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  41.79 
 
 		 533 aa  395  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  42.78 
 
 		 533 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  41.53 
 
 		 532 aa  392  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  41.52 
 
 		 533 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2350  preprotein translocase subunit SecD  42.24 
 
 		 618 aa  389  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.951904  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  41.86 
 
 		 533 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.55 
 
 		 856 aa  378  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  41.36 
 
 		 632 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.82 
 
 		 856 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  41.36 
 
 		 632 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  41.28 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.28 
 
 		 853 aa  364  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  40.59 
 
 		 625 aa  363  3e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  42.05 
 
 		 621 aa  363  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  39.34 
 
 		 632 aa  363  6e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  40.75 
 
 		 526 aa  362  9e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.94 
 
 		 839 aa  361  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  41.2 
 
 		 526 aa  361  2e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  38.92 
 
 		 531 aa  359  6e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2427  preprotein translocase subunit SecD  42.69 
 
 		 614 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  40.43 
 
 		 554 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  39.22 
 
 		 640 aa  356  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  41.42 
 
 		 510 aa  356  5.999999999999999e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  42.24 
 
 		 521 aa  355  1e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  39.19 
 
 		 529 aa  354  2.9999999999999997e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  40.74 
 
 		 554 aa  352  7e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3866  preprotein translocase subunit SecD  40.04 
 
 		 626 aa  351  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  40.41 
 
 		 531 aa  351  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.7 
 
 		 848 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  38.68 
 
 		 609 aa  348  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.21 
 
 		 849 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  39.85 
 
 		 604 aa  347  3e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.23 
 
 		 844 aa  347  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  39.14 
 
 		 532 aa  347  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  40.34 
 
 		 636 aa  346  5e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.4 
 
 		 845 aa  346  6e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.22 
 
 		 844 aa  344  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  39.53 
 
 		 537 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  38.86 
 
 		 623 aa  343  4e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0146  protein-export membrane protein SecD  39.53 
 
 		 535 aa  343  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00836416  hitchhiker  0.00269224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  40.6 
 
 		 535 aa  343  5e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1696  preprotein translocase subunit SecD  39.09 
 
 		 618 aa  343  5e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  38.93 
 
 		 512 aa  343  5.999999999999999e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  38.43 
 
 		 556 aa  343  5.999999999999999e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0344  preprotein translocase subunit SecD  39.46 
 
 		 633 aa  342  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  37.01 
 
 		 614 aa  342  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  39.61 
 
 		 533 aa  341  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  39.2 
 
 		 521 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  38.82 
 
 		 554 aa  340  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  40.08 
 
 		 522 aa  339  7e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  38.82 
 
 		 534 aa  339  8e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  39.42 
 
 		 534 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0277  preprotein translocase subunit SecD  38.62 
 
 		 626 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  39.88 
 
 		 554 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  39.3 
 
 		 532 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5119  preprotein translocase subunit SecD  39.07 
 
 		 627 aa  336  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  39.3 
 
 		 532 aa  336  7e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  38.39 
 
 		 595 aa  336  7e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  39.62 
 
 		 534 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  35.63 
 
 		 616 aa  335  1e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1218  preprotein translocase subunit SecD  38.21 
 
 		 621 aa  335  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518755 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  34.68 
 
 		 613 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01347  preprotein translocase subunit SecD  37.27 
 
 		 599 aa  334  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1303  protein-export membrane protein SecD  38.17 
 
 		 622 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.41 
 
 		 844 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  34.62 
 
 		 613 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  34.52 
 
 		 613 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  45.1 
 
 		 473 aa  331  2e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2212  protein-export membrane protein SecD  37.99 
 
 		 620 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363799  normal  0.0593357 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1331  protein-export membrane protein SecD  38.7 
 
 		 625 aa  330  3e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0264501  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3885  preprotein translocase subunit SecD  39.22 
 
 		 625 aa  330  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1122  preprotein translocase subunit SecD  37.62 
 
 		 615 aa  330  5.0000000000000004e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276034  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  38.69 
 
 		 554 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  38.69 
 
 		 554 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2482  preprotein translocase subunit SecD  37.71 
 
 		 616 aa  329  6e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000187651  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1449  preprotein translocase subunit SecD  37.52 
 
 		 616 aa  329  8e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00202636  normal  0.0146122 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  34.98 
 
 		 615 aa  329  8e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>