More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1341 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  66.16 
 
 		 526 aa  687    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  65.79 
 
 		 530 aa  729    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 532 aa  1059    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  79.51 
 
 		 532 aa  856    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  60.15 
 
 		 533 aa  627  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  60.11 
 
 		 531 aa  621  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  49.34 
 
 		 533 aa  482  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  45.69 
 
 		 533 aa  472  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  45.15 
 
 		 533 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  50.09 
 
 		 524 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  45.64 
 
 		 530 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  44.38 
 
 		 532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  44.57 
 
 		 532 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  45.52 
 
 		 533 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  44.03 
 
 		 530 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  45.34 
 
 		 533 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  43.57 
 
 		 525 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  41.39 
 
 		 534 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  42.94 
 
 		 535 aa  382  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  45.1 
 
 		 521 aa  369  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  42.86 
 
 		 632 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  43.05 
 
 		 632 aa  372  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  40.96 
 
 		 533 aa  372  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  40.6 
 
 		 532 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  43.4 
 
 		 632 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  43.17 
 
 		 529 aa  367  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  44.25 
 
 		 604 aa  363  4e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  44.86 
 
 		 510 aa  361  1e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  41.39 
 
 		 531 aa  360  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.55 
 
 		 856 aa  360  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  44.38 
 
 		 640 aa  359  7e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  44.21 
 
 		 625 aa  358  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2427  preprotein translocase subunit SecD  45.02 
 
 		 614 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  40.57 
 
 		 532 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  41.23 
 
 		 533 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  43.93 
 
 		 594 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  43.93 
 
 		 594 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  40.88 
 
 		 533 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  42.69 
 
 		 526 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  40.67 
 
 		 534 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  40.93 
 
 		 533 aa  353  5e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3866  preprotein translocase subunit SecD  44.6 
 
 		 626 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  42.08 
 
 		 512 aa  351  2e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  40.75 
 
 		 537 aa  350  4e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  38.21 
 
 		 532 aa  350  5e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  40.93 
 
 		 533 aa  349  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  40.38 
 
 		 526 aa  347  2e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  43.6 
 
 		 609 aa  345  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.99 
 
 		 853 aa  345  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0344  preprotein translocase subunit SecD  42.8 
 
 		 633 aa  345  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  40 
 
 		 531 aa  344  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  40.19 
 
 		 522 aa  343  5e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  42.03 
 
 		 636 aa  343  7e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2350  preprotein translocase subunit SecD  42.35 
 
 		 618 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.951904  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5119  preprotein translocase subunit SecD  43 
 
 		 627 aa  340  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  44.89 
 
 		 621 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  41.82 
 
 		 621 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  39.44 
 
 		 535 aa  338  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  38.24 
 
 		 551 aa  338  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.22 
 
 		 856 aa  337  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  40.86 
 
 		 614 aa  337  5e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2715  preprotein translocase subunit SecD  41.98 
 
 		 626 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.177706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  41.09 
 
 		 554 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  41.09 
 
 		 554 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  40.4 
 
 		 554 aa  333  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41 
 
 		 844 aa  332  7.000000000000001e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  40.59 
 
 		 554 aa  332  8e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1236  preprotein translocase subunit SecD  40.97 
 
 		 526 aa  332  9e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.543695  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3885  preprotein translocase subunit SecD  43.45 
 
 		 625 aa  332  9e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1111  preprotein translocase subunit SecD  40.71 
 
 		 526 aa  331  2e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.789718  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0630  preprotein translocase subunit SecD  39.89 
 
 		 526 aa  330  3e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2959  preprotein translocase subunit SecD  41.2 
 
 		 629 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  37.96 
 
 		 535 aa  330  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2549  preprotein translocase subunit SecD  41.77 
 
 		 629 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370381  normal  0.188242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0277  preprotein translocase subunit SecD  42.98 
 
 		 626 aa  330  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2835  preprotein translocase subunit SecD  40.16 
 
 		 616 aa  329  7e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  39.37 
 
 		 521 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  35.61 
 
 		 613 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1303  protein-export membrane protein SecD  41.21 
 
 		 622 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  35.45 
 
 		 613 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  39.84 
 
 		 554 aa  326  5e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.71 
 
 		 845 aa  324  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  41.8 
 
 		 623 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.89 
 
 		 839 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2184  protein-export membrane protein SecD  41.8 
 
 		 620 aa  323  6e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.33 
 
 		 844 aa  322  8e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  39.6 
 
 		 534 aa  319  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.62 
 
 		 834 aa  318  1e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4645  preprotein translocase subunit SecD  42.94 
 
 		 624 aa  318  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2946  preprotein translocase subunit SecD  41.77 
 
 		 621 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004365  protein-export membrane protein SecD  40.15 
 
 		 607 aa  317  4e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59973  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  38.84 
 
 		 534 aa  317  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  45.15 
 
 		 473 aa  316  6e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  40.04 
 
 		 533 aa  316  6e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.14 
 
 		 848 aa  316  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.82 
 
 		 849 aa  316  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1291  protein-export membrane protein SecD  40.08 
 
 		 622 aa  315  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.00000000000000635694  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  38.42 
 
 		 607 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01048  preprotein translocase subunit SecD  40 
 
 		 607 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0146  protein-export membrane protein SecD  40.08 
 
 		 535 aa  313  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00836416  hitchhiker  0.00269224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>