More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1410 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 613 aa  1239    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  99.02 
 
 		 613 aa  1234    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  97.39 
 
 		 613 aa  1217    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1323  protein-export membrane protein SecD  75.12 
 
 		 611 aa  928    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.970602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  35.58 
 
 		 532 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  35.37 
 
 		 530 aa  339  7e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  34.78 
 
 		 532 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  38.65 
 
 		 533 aa  329  8e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  36.89 
 
 		 533 aa  325  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  36.16 
 
 		 605 aa  321  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  36.75 
 
 		 594 aa  318  1e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  34.89 
 
 		 534 aa  317  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  34.53 
 
 		 595 aa  313  4.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  33.07 
 
 		 533 aa  312  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  36.13 
 
 		 622 aa  306  6e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  35.84 
 
 		 619 aa  306  6e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  34.45 
 
 		 607 aa  299  1e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2396  protein-export membrane protein SecD  33.89 
 
 		 637 aa  297  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0013  preprotein translocase subunit SecD  35.45 
 
 		 624 aa  293  8e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295061  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  33.96 
 
 		 638 aa  291  3e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  31.83 
 
 		 526 aa  280  5e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  36.95 
 
 		 1029 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  32.84 
 
 		 535 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  33.99 
 
 		 525 aa  275  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  33.85 
 
 		 614 aa  274  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  31.18 
 
 		 522 aa  273  5.000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  36.2 
 
 		 473 aa  272  1e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  33.18 
 
 		 532 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  33.76 
 
 		 524 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2350  preprotein translocase subunit SecD  35.04 
 
 		 618 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.951904  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  48.79 
 
 		 533 aa  270  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  32.66 
 
 		 512 aa  270  8e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  42.93 
 
 		 594 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  42.93 
 
 		 594 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  32.91 
 
 		 521 aa  264  4e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  33.03 
 
 		 521 aa  263  6e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  50.72 
 
 		 532 aa  263  6e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  49.12 
 
 		 531 aa  262  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  52.13 
 
 		 530 aa  262  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  32.83 
 
 		 532 aa  261  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  31.61 
 
 		 533 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31 
 
 		 995 aa  257  3e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  31.95 
 
 		 510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30 
 
 		 991 aa  252  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  37.56 
 
 		 470 aa  250  5e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3095  preprotein translocase subunit SecD  33.62 
 
 		 604 aa  250  7e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  37.75 
 
 		 533 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  31.91 
 
 		 554 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  32.56 
 
 		 616 aa  248  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  45.88 
 
 		 530 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  40.75 
 
 		 457 aa  248  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  47.55 
 
 		 843 aa  248  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  31.87 
 
 		 529 aa  245  1.9999999999999999e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1236  preprotein translocase subunit SecD  31.7 
 
 		 526 aa  244  3e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.543695  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  46.85 
 
 		 534 aa  244  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1111  preprotein translocase subunit SecD  31.52 
 
 		 526 aa  243  9e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.789718  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  37.73 
 
 		 471 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  47.2 
 
 		 533 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2191  preprotein translocase subunit SecD  33.94 
 
 		 616 aa  242  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111681  decreased coverage  0.00360319 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  36.22 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  44.57 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  45.24 
 
 		 554 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1230  preprotein translocase subunit SecD  31.98 
 
 		 622 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.888537 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05361  preprotein translocase subunit SecD  31.64 
 
 		 612 aa  240  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  44.76 
 
 		 533 aa  240  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  36.36 
 
 		 464 aa  240  5.999999999999999e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.71 
 
 		 981 aa  239  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45.33 
 
 		 849 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  44.29 
 
 		 554 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  46.86 
 
 		 623 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  44.76 
 
 		 533 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  44.29 
 
 		 554 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.54 
 
 		 848 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  41.62 
 
 		 533 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.06 
 
 		 856 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  41.34 
 
 		 533 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.21 
 
 		 853 aa  234  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  49.28 
 
 		 526 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  43.23 
 
 		 625 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.8 
 
 		 839 aa  231  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1240  protein translocase subunit  43.65 
 
 		 622 aa  231  4e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00253338  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  45.07 
 
 		 556 aa  231  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  31.28 
 
 		 554 aa  230  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1291  protein-export membrane protein SecD  43.65 
 
 		 622 aa  230  7e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.00000000000000635694  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1303  protein-export membrane protein SecD  44.83 
 
 		 622 aa  230  7e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  43.62 
 
 		 406 aa  229  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  35.94 
 
 		 526 aa  229  1e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.03 
 
 		 995 aa  229  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1122  preprotein translocase subunit SecD  46.69 
 
 		 615 aa  228  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276034  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  35.24 
 
 		 515 aa  228  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  36.69 
 
 		 464 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  42.12 
 
 		 609 aa  227  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  41.79 
 
 		 554 aa  227  6e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  42.62 
 
 		 531 aa  226  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0681  preprotein translocase subunit SecD  33.11 
 
 		 587 aa  225  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.32 
 
 		 996 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  33.26 
 
 		 472 aa  224  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0865  preprotein translocase subunit SecD  31.19 
 
 		 620 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0679979  normal  0.748339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  46.49 
 
 		 534 aa  223  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  43.93 
 
 		 621 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>