More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0146 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0146  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 535 aa  1078    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00836416  hitchhiker  0.00269224 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  39.59 
 
 		 530 aa  364  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  40.52 
 
 		 530 aa  360  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  39.27 
 
 		 533 aa  360  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  40.71 
 
 		 532 aa  353  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  38.78 
 
 		 533 aa  352  8e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  39.63 
 
 		 533 aa  350  4e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  39.03 
 
 		 532 aa  349  9e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  37.96 
 
 		 525 aa  346  8e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  39.7 
 
 		 524 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  39.56 
 
 		 530 aa  339  8e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  40.19 
 
 		 533 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  41.78 
 
 		 533 aa  332  7.000000000000001e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  38.73 
 
 		 532 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  38.42 
 
 		 532 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  37.06 
 
 		 532 aa  324  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  37.29 
 
 		 534 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  38.05 
 
 		 531 aa  323  7e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  37.25 
 
 		 533 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  38.49 
 
 		 533 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  38.11 
 
 		 533 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  37.77 
 
 		 534 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  38.04 
 
 		 512 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  37.7 
 
 		 554 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  37.86 
 
 		 554 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  37.7 
 
 		 554 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  38.57 
 
 		 535 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  37.55 
 
 		 533 aa  316  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  36.52 
 
 		 554 aa  315  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  38.12 
 
 		 526 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  37.8 
 
 		 556 aa  311  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  37.93 
 
 		 533 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  37.95 
 
 		 614 aa  310  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  37.3 
 
 		 594 aa  309  8e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  37.3 
 
 		 594 aa  309  8e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  36.63 
 
 		 533 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2715  preprotein translocase subunit SecD  35.97 
 
 		 626 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.177706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  36.62 
 
 		 554 aa  306  7e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1303  protein-export membrane protein SecD  37.38 
 
 		 622 aa  306  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  36.83 
 
 		 554 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2184  protein-export membrane protein SecD  39.18 
 
 		 620 aa  303  5.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  36.17 
 
 		 531 aa  302  8.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  37.43 
 
 		 535 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2549  preprotein translocase subunit SecD  35.38 
 
 		 629 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370381  normal  0.188242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2959  preprotein translocase subunit SecD  35.38 
 
 		 629 aa  300  6e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  35.88 
 
 		 532 aa  299  7e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.66 
 
 		 839 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  37.34 
 
 		 623 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  34.6 
 
 		 632 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  40.35 
 
 		 473 aa  294  3e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2527  preprotein translocase subunit SecD  36.38 
 
 		 681 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1218  preprotein translocase subunit SecD  38.61 
 
 		 621 aa  293  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518755 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.68 
 
 		 853 aa  293  6e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2212  protein-export membrane protein SecD  36.19 
 
 		 620 aa  293  7e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363799  normal  0.0593357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01347  preprotein translocase subunit SecD  36.48 
 
 		 599 aa  292  9e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  34.98 
 
 		 621 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.44 
 
 		 856 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  36.23 
 
 		 500 aa  291  3e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  34.91 
 
 		 632 aa  291  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.3 
 
 		 856 aa  290  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2350  preprotein translocase subunit SecD  37.08 
 
 		 618 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.951904  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2835  preprotein translocase subunit SecD  37.3 
 
 		 616 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  35.88 
 
 		 531 aa  289  7e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1696  preprotein translocase subunit SecD  38.83 
 
 		 618 aa  289  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  34.91 
 
 		 632 aa  289  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.15 
 
 		 848 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  35.4 
 
 		 616 aa  286  7e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0701  preprotein translocase subunit SecD  36.24 
 
 		 687 aa  286  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004365  protein-export membrane protein SecD  37.67 
 
 		 607 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59973  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01048  preprotein translocase subunit SecD  37.48 
 
 		 607 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  35.94 
 
 		 521 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3992  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 		 695 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.725975  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2335  preprotein translocase subunit SecD  35.56 
 
 		 616 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00244246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.95 
 
 		 849 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  35.96 
 
 		 609 aa  282  9e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  34.8 
 
 		 640 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2433  preprotein translocase subunit SecD  37.07 
 
 		 618 aa  282  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  37.94 
 
 		 534 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1791  protein-export membrane protein SecD  37.02 
 
 		 619 aa  281  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.779006  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3262  preprotein translocase subunit SecD  34.37 
 
 		 604 aa  281  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103027  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2946  preprotein translocase subunit SecD  35.74 
 
 		 621 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2890  preprotein translocase subunit SecD  35.93 
 
 		 616 aa  281  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.703354  hitchhiker  0.000286958 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  34.44 
 
 		 526 aa  281  3e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3121  preprotein translocase subunit SecD  34.37 
 
 		 615 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3382  preprotein translocase subunit SecD  34.37 
 
 		 615 aa  280  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00120261  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1122  preprotein translocase subunit SecD  36.73 
 
 		 615 aa  280  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276034  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 		 521 aa  280  5e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  34.39 
 
 		 625 aa  279  9e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  34.05 
 
 		 615 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  35.77 
 
 		 535 aa  279  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1472  preprotein translocase subunit SecD  36.89 
 
 		 610 aa  279  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00356  protein export protein SecD  33.83 
 
 		 615 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.698554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3201  protein-export membrane protein SecD  33.83 
 
 		 604 aa  277  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.167397  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0327  preprotein translocase subunit SecD  33.83 
 
 		 615 aa  277  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.328268  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0438  preprotein translocase subunit SecD  33.83 
 
 		 615 aa  277  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0478  preprotein translocase subunit SecD  33.83 
 
 		 615 aa  277  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0440  preprotein translocase subunit SecD  33.83 
 
 		 615 aa  277  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00360  hypothetical protein  33.83 
 
 		 615 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.674482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0488  preprotein translocase subunit SecD  33.83 
 
 		 615 aa  277  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3225  preprotein translocase subunit SecD  33.83 
 
 		 604 aa  277  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.457914  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>