More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0512 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_5119  preprotein translocase subunit SecD  57.65 
 
 
627 aa  706    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2715  preprotein translocase subunit SecD  54.85 
 
 
626 aa  685    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.177706 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2549  preprotein translocase subunit SecD  53.55 
 
 
629 aa  661    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370381  normal  0.188242 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  63.36 
 
 
625 aa  785    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  54.93 
 
 
621 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  63.32 
 
 
604 aa  751    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2959  preprotein translocase subunit SecD  53.39 
 
 
629 aa  661    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  59.94 
 
 
636 aa  714    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  60.26 
 
 
632 aa  764    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0277  preprotein translocase subunit SecD  59.93 
 
 
626 aa  727    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2427  preprotein translocase subunit SecD  63.55 
 
 
614 aa  740    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3866  preprotein translocase subunit SecD  59.61 
 
 
626 aa  729    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 
609 aa  1228    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4645  preprotein translocase subunit SecD  59.45 
 
 
624 aa  693    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3992  preprotein translocase subunit SecD  53.78 
 
 
695 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.725975  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0701  preprotein translocase subunit SecD  53.62 
 
 
687 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599175  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2946  preprotein translocase subunit SecD  55.25 
 
 
621 aa  654    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  62.5 
 
 
621 aa  729    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2527  preprotein translocase subunit SecD  53.47 
 
 
681 aa  643    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  61.07 
 
 
632 aa  767    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3885  preprotein translocase subunit SecD  59.93 
 
 
625 aa  705    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527535  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  61.07 
 
 
632 aa  769    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  61.07 
 
 
640 aa  752    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0344  preprotein translocase subunit SecD  58.96 
 
 
633 aa  714    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  54.23 
 
 
623 aa  633  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1791  protein-export membrane protein SecD  55.02 
 
 
619 aa  617  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.779006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2350  preprotein translocase subunit SecD  53.92 
 
 
618 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.951904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3808  preprotein translocase subunit SecD  53.47 
 
 
674 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2666  preprotein translocase subunit SecD  52.83 
 
 
673 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.607509 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0236  preprotein translocase subunit SecD  53.31 
 
 
673 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0720  preprotein translocase subunit SecD  53.31 
 
 
673 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0688  preprotein translocase subunit SecD  53.15 
 
 
673 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.70509 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0635  preprotein translocase subunit SecD  52.99 
 
 
673 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0610  preprotein translocase subunit SecD  52.99 
 
 
673 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0683  preprotein translocase subunit SecD  53.13 
 
 
616 aa  599  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.760335  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1508  protein-export membrane protein SecD  53.24 
 
 
619 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.512393 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2385  preprotein translocase subunit SecD  52.59 
 
 
675 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3373  preprotein translocase subunit SecD  52.59 
 
 
674 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3330  preprotein translocase subunit SecD  52.59 
 
 
675 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1163  preprotein translocase subunit SecD  52.59 
 
 
675 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.251758  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1276  preprotein translocase subunit SecD  52.43 
 
 
673 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2571  preprotein translocase subunit SecD  52.59 
 
 
675 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0301  preprotein translocase subunit SecD  52.59 
 
 
675 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3364  preprotein translocase subunit SecD  52.59 
 
 
674 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  47.6 
 
 
614 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2184  protein-export membrane protein SecD  48.48 
 
 
620 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1303  protein-export membrane protein SecD  48.48 
 
 
622 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3121  preprotein translocase subunit SecD  46.4 
 
 
615 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3382  preprotein translocase subunit SecD  46.4 
 
 
615 aa  552  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00120261  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  45.95 
 
 
615 aa  548  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1331  protein-export membrane protein SecD  48.96 
 
 
625 aa  541  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0264501  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2433  preprotein translocase subunit SecD  47.04 
 
 
618 aa  539  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00356  protein export protein SecD  45.95 
 
 
615 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.698554  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00360  hypothetical protein  45.95 
 
 
615 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.674482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0488  preprotein translocase subunit SecD  45.95 
 
 
615 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0478  preprotein translocase subunit SecD  45.95 
 
 
615 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0327  preprotein translocase subunit SecD  45.95 
 
 
615 aa  536  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.328268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0440  preprotein translocase subunit SecD  45.95 
 
 
615 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0438  preprotein translocase subunit SecD  45.95 
 
 
615 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1218  preprotein translocase subunit SecD  47.04 
 
 
621 aa  536  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.518755 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  45.69 
 
 
616 aa  535  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1437  preprotein translocase subunit SecD  46.66 
 
 
616 aa  532  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013441  hitchhiker  0.000143717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0466  preprotein translocase subunit SecD  44.83 
 
 
615 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0877  preprotein translocase subunit SecD  45.79 
 
 
615 aa  530  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0507  preprotein translocase subunit SecD  44.83 
 
 
615 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.714923  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0447  preprotein translocase subunit SecD  44.83 
 
 
615 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0446  preprotein translocase subunit SecD  45.15 
 
 
615 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2191  preprotein translocase subunit SecD  47.13 
 
 
616 aa  531  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111681  decreased coverage  0.00360319 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0453  preprotein translocase subunit SecD  45.15 
 
 
615 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3262  preprotein translocase subunit SecD  45.69 
 
 
604 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103027  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1449  preprotein translocase subunit SecD  46.5 
 
 
616 aa  531  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00202636  normal  0.0146122 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1122  preprotein translocase subunit SecD  46.74 
 
 
615 aa  527  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276034  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1384  preprotein translocase subunit SecD  46.18 
 
 
616 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000494152  hitchhiker  0.000000727457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2805  preprotein translocase subunit SecD  45.86 
 
 
616 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000153559  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1472  preprotein translocase subunit SecD  46.55 
 
 
610 aa  525  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1982  preprotein translocase subunit SecD  46.89 
 
 
618 aa  522  1e-147  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2785  preprotein translocase subunit SecD  45.86 
 
 
616 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000401853  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0272  preprotein translocase subunit SecD  45.99 
 
 
617 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424344  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1291  protein-export membrane protein SecD  45.77 
 
 
622 aa  524  1e-147  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.00000000000000635694  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2880  preprotein translocase subunit SecD  45.86 
 
 
616 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000488716  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3111  preprotein translocase subunit SecD  45.54 
 
 
616 aa  521  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1977  preprotein translocase subunit SecD  46.89 
 
 
618 aa  520  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1240  protein translocase subunit  45.61 
 
 
622 aa  520  1e-146  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00253338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1572  preprotein translocase subunit SecD  45.7 
 
 
616 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000232578  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2482  preprotein translocase subunit SecD  45.38 
 
 
616 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000187651  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01347  preprotein translocase subunit SecD  46.07 
 
 
599 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004365  protein-export membrane protein SecD  45.69 
 
 
607 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3201  protein-export membrane protein SecD  45.4 
 
 
604 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.167397  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2212  protein-export membrane protein SecD  44.96 
 
 
620 aa  514  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363799  normal  0.0593357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1758  preprotein translocase subunit SecD  45.54 
 
 
616 aa  514  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000231591  hitchhiker  0.0025184 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01048  preprotein translocase subunit SecD  45.37 
 
 
607 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2890  preprotein translocase subunit SecD  45.7 
 
 
616 aa  514  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.703354  hitchhiker  0.000286958 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3225  preprotein translocase subunit SecD  45.4 
 
 
604 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.457914  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1021  preprotein translocase subunit SecD  45.07 
 
 
604 aa  511  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3289  preprotein translocase subunit SecD  44.57 
 
 
604 aa  511  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2335  preprotein translocase subunit SecD  45.38 
 
 
616 aa  510  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00244246  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3518  preprotein translocase subunit SecD  44.43 
 
 
622 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0852936  normal  0.362188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1116  preprotein translocase subunit SecD  44.76 
 
 
624 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.818418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14630  preprotein translocase subunit SecD  43.82 
 
 
620 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1292  preprotein translocase subunit SecD  44.14 
 
 
620 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>