More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1899 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 551 aa  1092    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.36 
 
 		 856 aa  455  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  46.39 
 
 		 535 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  46.22 
 
 		 534 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  45.01 
 
 		 533 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  44.83 
 
 		 533 aa  438  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  44.46 
 
 		 532 aa  431  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44 
 
 		 856 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  43.12 
 
 		 532 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  44.28 
 
 		 533 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  44.85 
 
 		 533 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  45.01 
 
 		 533 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  42.47 
 
 		 531 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  43.97 
 
 		 556 aa  416  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  42.46 
 
 		 554 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  42.66 
 
 		 554 aa  411  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  41.59 
 
 		 535 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  41.11 
 
 		 554 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  41.3 
 
 		 532 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  41.12 
 
 		 554 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  42.13 
 
 		 554 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  42.13 
 
 		 554 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  41.2 
 
 		 534 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  41.2 
 
 		 532 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  41.2 
 
 		 532 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  41.02 
 
 		 533 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  40.18 
 
 		 535 aa  388  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  38.91 
 
 		 531 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  40.93 
 
 		 537 aa  382  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  40.76 
 
 		 534 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  40.69 
 
 		 534 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.89 
 
 		 853 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.36 
 
 		 839 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.67 
 
 		 848 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.2 
 
 		 849 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  37.66 
 
 		 530 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  38.24 
 
 		 532 aa  355  1e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  37.63 
 
 		 532 aa  352  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  37.06 
 
 		 533 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  36.12 
 
 		 530 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.04 
 
 		 845 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.85 
 
 		 844 aa  335  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.45 
 
 		 844 aa  333  5e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.47 
 
 		 844 aa  333  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  34.77 
 
 		 530 aa  329  7e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  37.61 
 
 		 526 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  35.88 
 
 		 533 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  36.73 
 
 		 533 aa  325  9e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.06 
 
 		 834 aa  322  9.999999999999999e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  35.42 
 
 		 843 aa  319  7e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  35.21 
 
 		 531 aa  319  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  35.57 
 
 		 533 aa  319  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  38.79 
 
 		 524 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  33.51 
 
 		 532 aa  318  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  38.35 
 
 		 533 aa  318  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  37.28 
 
 		 533 aa  316  6e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.69 
 
 		 846 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  35.5 
 
 		 525 aa  313  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  35.6 
 
 		 501 aa  313  5.999999999999999e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  33.03 
 
 		 532 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.78 
 
 		 846 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  37.65 
 
 		 594 aa  300  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  37.65 
 
 		 594 aa  300  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  33.58 
 
 		 505 aa  294  3e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  37.55 
 
 		 632 aa  293  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  34.32 
 
 		 508 aa  289  7e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  39.42 
 
 		 604 aa  286  9e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  33.77 
 
 		 526 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  36.87 
 
 		 625 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0627  protein-export membrane protein SecD  36.9 
 
 		 502 aa  281  3e-74  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57035  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2350  preprotein translocase subunit SecD  37.34 
 
 		 618 aa  279  8e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.951904  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  34.27 
 
 		 529 aa  279  8e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  37.11 
 
 		 521 aa  279  1e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  36.93 
 
 		 632 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  31.29 
 
 		 534 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  36.73 
 
 		 632 aa  276  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  34.95 
 
 		 614 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2715  preprotein translocase subunit SecD  35.87 
 
 		 626 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.177706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  37.97 
 
 		 623 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  37.79 
 
 		 636 aa  274  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  36.78 
 
 		 510 aa  273  7e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  37.19 
 
 		 406 aa  273  7e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1303  protein-export membrane protein SecD  37.15 
 
 		 622 aa  272  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  35.87 
 
 		 621 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1403  preprotein translocase subunit SecD  35.15 
 
 		 616 aa  270  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00249908  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2427  preprotein translocase subunit SecD  40.37 
 
 		 614 aa  270  7e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01347  preprotein translocase subunit SecD  36.83 
 
 		 599 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  40.51 
 
 		 399 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5119  preprotein translocase subunit SecD  36.18 
 
 		 627 aa  267  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004365  protein-export membrane protein SecD  35.19 
 
 		 607 aa  267  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59973  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  38.55 
 
 		 609 aa  266  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  36.38 
 
 		 521 aa  265  1e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1449  preprotein translocase subunit SecD  33.58 
 
 		 616 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00202636  normal  0.0146122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1437  preprotein translocase subunit SecD  33.58 
 
 		 616 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013441  hitchhiker  0.000143717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  37.7 
 
 		 621 aa  265  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2880  preprotein translocase subunit SecD  34.9 
 
 		 616 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000488716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2805  preprotein translocase subunit SecD  34.9 
 
 		 616 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000153559  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  33.08 
 
 		 522 aa  265  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2785  preprotein translocase subunit SecD  34.9 
 
 		 616 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000401853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01048  preprotein translocase subunit SecD  35.19 
 
 		 607 aa  264  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>