More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0878 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  64.9 
 
 
845 aa  1075    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  56.08 
 
 
849 aa  944    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  56.06 
 
 
848 aa  952    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.4 
 
 
853 aa  714    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  53.61 
 
 
844 aa  874    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  63.52 
 
 
844 aa  1063    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  55.94 
 
 
839 aa  905    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  64.54 
 
 
844 aa  1067    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  100 
 
 
834 aa  1670    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.05 
 
 
856 aa  623  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  41.94 
 
 
843 aa  620  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.32 
 
 
856 aa  607  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.15 
 
 
846 aa  528  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.2 
 
 
846 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.3 
 
 
858 aa  462  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  45.64 
 
 
535 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.65 
 
 
759 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.5 
 
 
785 aa  445  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  46.18 
 
 
533 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.5 
 
 
785 aa  444  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  44.38 
 
 
535 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  44.19 
 
 
534 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  42.83 
 
 
532 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  44.11 
 
 
533 aa  431  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  44.38 
 
 
533 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  43.43 
 
 
533 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  43.43 
 
 
533 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  45.34 
 
 
532 aa  411  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  43.75 
 
 
531 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  43.27 
 
 
532 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  41.94 
 
 
534 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  43.95 
 
 
533 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  43.27 
 
 
532 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  41.64 
 
 
534 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  42.72 
 
 
534 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  34.15 
 
 
735 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  33.76 
 
 
761 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  42.74 
 
 
554 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  38.29 
 
 
554 aa  382  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  35.46 
 
 
740 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  38.7 
 
 
554 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  43.06 
 
 
554 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  43.06 
 
 
554 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.81 
 
 
762 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  34.7 
 
 
759 aa  367  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  38.3 
 
 
531 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  39.48 
 
 
533 aa  365  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  34.46 
 
 
748 aa  364  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  39.02 
 
 
556 aa  364  4e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  38.39 
 
 
554 aa  364  4e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  39.37 
 
 
525 aa  363  6e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  33.71 
 
 
849 aa  362  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  38.81 
 
 
535 aa  360  6e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.13 
 
 
995 aa  360  9e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.01 
 
 
756 aa  355  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  38.01 
 
 
530 aa  355  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  39.44 
 
 
537 aa  352  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  40.3 
 
 
526 aa  349  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  38.83 
 
 
532 aa  348  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  37.62 
 
 
532 aa  347  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  37.68 
 
 
532 aa  343  7e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  38.85 
 
 
594 aa  342  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  38.85 
 
 
594 aa  342  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  37.96 
 
 
532 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  40.34 
 
 
533 aa  340  4e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  39.17 
 
 
530 aa  340  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  38.58 
 
 
501 aa  337  5.999999999999999e-91  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  39.39 
 
 
505 aa  337  7.999999999999999e-91  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  38.98 
 
 
531 aa  336  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  39.62 
 
 
532 aa  335  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  41.81 
 
 
533 aa  335  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  36.92 
 
 
533 aa  334  5e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  37 
 
 
632 aa  333  7.000000000000001e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  36.93 
 
 
551 aa  333  8e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  38.77 
 
 
508 aa  333  9e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  38.63 
 
 
533 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  37 
 
 
632 aa  332  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  36.82 
 
 
632 aa  331  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  36.96 
 
 
530 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.35 
 
 
981 aa  329  1.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.05 
 
 
1055 aa  325  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.61 
 
 
995 aa  323  9.999999999999999e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  35.89 
 
 
534 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.94 
 
 
991 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  34.8 
 
 
1029 aa  321  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  37.45 
 
 
533 aa  320  7e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  37.24 
 
 
625 aa  320  7.999999999999999e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  38.29 
 
 
524 aa  320  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.17 
 
 
996 aa  317  6e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  37.7 
 
 
616 aa  317  6e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.36 
 
 
991 aa  314  4.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0344  preprotein translocase subunit SecD  37.11 
 
 
633 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  37.5 
 
 
640 aa  310  9e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.29 
 
 
990 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  37.18 
 
 
636 aa  309  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2959  preprotein translocase subunit SecD  38.92 
 
 
629 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.44 
 
 
754 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2549  preprotein translocase subunit SecD  39.44 
 
 
629 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370381  normal  0.188242 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.3 
 
 
754 aa  308  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.36 
 
 
754 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>