More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2336 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  89.2 
 
 
785 aa  1301    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  100 
 
 
759 aa  1511    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.08 
 
 
856 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  89.06 
 
 
785 aa  1300    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.35 
 
 
856 aa  610  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.92 
 
 
846 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.89 
 
 
846 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.8 
 
 
853 aa  502  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.35 
 
 
844 aa  500  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.85 
 
 
845 aa  481  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.66 
 
 
848 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.73 
 
 
844 aa  477  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.51 
 
 
849 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.17 
 
 
858 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.52 
 
 
839 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.65 
 
 
834 aa  451  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.48 
 
 
844 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  34.79 
 
 
843 aa  399  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  32.74 
 
 
849 aa  361  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  44.27 
 
 
533 aa  351  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  30.48 
 
 
735 aa  350  7e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  44 
 
 
532 aa  348  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.33 
 
 
762 aa  345  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  43.47 
 
 
533 aa  344  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  32.97 
 
 
759 aa  339  9e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  43.47 
 
 
533 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.54 
 
 
995 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  33.61 
 
 
740 aa  336  7.999999999999999e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  43.12 
 
 
534 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  43.09 
 
 
535 aa  332  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  44 
 
 
533 aa  331  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.89 
 
 
752 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  43.47 
 
 
533 aa  327  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.12 
 
 
1055 aa  323  7e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.93 
 
 
754 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.93 
 
 
754 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.93 
 
 
754 aa  321  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.79 
 
 
754 aa  321  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.79 
 
 
754 aa  320  6e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.79 
 
 
754 aa  320  6e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.65 
 
 
754 aa  320  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.79 
 
 
754 aa  319  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.79 
 
 
754 aa  319  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  32.36 
 
 
1029 aa  316  9e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.62 
 
 
755 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  33.33 
 
 
1001 aa  315  1.9999999999999998e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.96 
 
 
750 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  41.62 
 
 
535 aa  313  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.75 
 
 
995 aa  309  1.0000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.05 
 
 
750 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.08 
 
 
996 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  31.14 
 
 
761 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.38 
 
 
991 aa  303  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  38.87 
 
 
554 aa  301  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.44 
 
 
991 aa  298  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  40 
 
 
532 aa  297  6e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.44 
 
 
763 aa  296  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  31.98 
 
 
748 aa  295  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.44 
 
 
981 aa  295  3e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.46 
 
 
759 aa  293  9e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.46 
 
 
759 aa  293  9e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  30.62 
 
 
989 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.72 
 
 
990 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  37.3 
 
 
531 aa  286  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  39.25 
 
 
554 aa  284  5.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  36.32 
 
 
535 aa  282  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  38.77 
 
 
531 aa  282  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.91 
 
 
756 aa  281  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  38.13 
 
 
556 aa  279  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  38.27 
 
 
554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  37.33 
 
 
554 aa  275  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  42.48 
 
 
357 aa  275  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  37.33 
 
 
554 aa  275  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  39.24 
 
 
534 aa  273  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  36.19 
 
 
554 aa  270  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1501  protein-export membrane protein SecD  28.88 
 
 
793 aa  269  1e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.365573  normal  0.0601553 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  28.98 
 
 
977 aa  270  1e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  37.37 
 
 
537 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.82 
 
 
911 aa  266  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  37.6 
 
 
534 aa  265  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  37.33 
 
 
594 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  37.33 
 
 
594 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  37.87 
 
 
533 aa  263  8e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  37.6 
 
 
534 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  42.86 
 
 
319 aa  262  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  37.6 
 
 
532 aa  260  8e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  37.6 
 
 
532 aa  260  9e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  34.15 
 
 
525 aa  255  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0733  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.73 
 
 
1400 aa  253  1e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  35.52 
 
 
530 aa  253  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  29.73 
 
 
855 aa  253  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  43.73 
 
 
316 aa  252  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  42.62 
 
 
318 aa  251  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3171  preprotein translocase subunit SecF  41.45 
 
 
372 aa  251  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  37 
 
 
551 aa  249  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  34.49 
 
 
532 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  38.84 
 
 
524 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  35.68 
 
 
532 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  35.36 
 
 
472 aa  245  1.9999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4405  preprotein translocase subunit SecF  41.23 
 
 
335 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0338927  normal  0.256135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>