More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0387 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  46.24 
 
 		 761 aa  713    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  100 
 
 		 911 aa  1808    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  47.05 
 
 		 756 aa  691    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  46.84 
 
 		 748 aa  675    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  59.21 
 
 		 885 aa  989    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1073  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.25 
 
 		 753 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0361267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  27.95 
 
 		 989 aa  342  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  28.17 
 
 		 977 aa  308  3e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  27.29 
 
 		 735 aa  298  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.3 
 
 		 856 aa  296  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.76 
 
 		 844 aa  295  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.23 
 
 		 856 aa  291  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.87 
 
 		 853 aa  287  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.63 
 
 		 848 aa  281  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.2 
 
 		 750 aa  281  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  27.4 
 
 		 849 aa  281  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.13 
 
 		 844 aa  280  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.34 
 
 		 759 aa  278  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.34 
 
 		 759 aa  278  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.45 
 
 		 991 aa  276  9e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.24 
 
 		 750 aa  276  9e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.06 
 
 		 849 aa  274  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.83 
 
 		 754 aa  271  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.83 
 
 		 754 aa  271  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  36.88 
 
 		 471 aa  270  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.25 
 
 		 754 aa  270  8e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  35.33 
 
 		 493 aa  270  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  35.34 
 
 		 470 aa  270  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.14 
 
 		 754 aa  269  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.6 
 
 		 754 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.6 
 
 		 754 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.35 
 
 		 995 aa  268  4e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.63 
 
 		 754 aa  267  7e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.02 
 
 		 754 aa  266  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.3 
 
 		 754 aa  265  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  35.4 
 
 		 470 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  35.4 
 
 		 470 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 		 495 aa  265  4e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  28.05 
 
 		 843 aa  264  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  35.1 
 
 		 474 aa  260  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  34.6 
 
 		 461 aa  258  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  34.65 
 
 		 495 aa  258  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  34.14 
 
 		 489 aa  255  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  26.42 
 
 		 1001 aa  251  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  35.01 
 
 		 464 aa  248  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.44 
 
 		 839 aa  248  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.29 
 
 		 981 aa  248  4.9999999999999997e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.73 
 
 		 834 aa  247  6e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  32.42 
 
 		 496 aa  244  7e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  32.09 
 
 		 496 aa  242  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  36.08 
 
 		 464 aa  241  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.71 
 
 		 996 aa  239  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.6 
 
 		 846 aa  238  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  33.4 
 
 		 525 aa  230  9e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.84 
 
 		 752 aa  229  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.85 
 
 		 755 aa  229  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  35.09 
 
 		 457 aa  229  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  32.6 
 
 		 533 aa  229  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.73 
 
 		 846 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  32.69 
 
 		 531 aa  226  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  32.66 
 
 		 487 aa  227  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  32.34 
 
 		 532 aa  224  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  31.13 
 
 		 532 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  29.44 
 
 		 486 aa  221  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  33.12 
 
 		 532 aa  220  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  31.3 
 
 		 530 aa  220  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  31.57 
 
 		 556 aa  219  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  33.69 
 
 		 535 aa  219  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  32.77 
 
 		 533 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  31.07 
 
 		 554 aa  219  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  30.02 
 
 		 487 aa  218  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  30.19 
 
 		 489 aa  218  5e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  32.69 
 
 		 533 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  32.33 
 
 		 532 aa  217  9e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  30.57 
 
 		 473 aa  217  9e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  32.32 
 
 		 531 aa  217  9e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  31.51 
 
 		 532 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  32.68 
 
 		 533 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  31.18 
 
 		 489 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  32.61 
 
 		 530 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  30.77 
 
 		 554 aa  214  7.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  30.9 
 
 		 554 aa  213  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  30.9 
 
 		 554 aa  213  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  31.29 
 
 		 554 aa  213  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  33.12 
 
 		 533 aa  212  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  35.23 
 
 		 524 aa  211  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.06 
 
 		 995 aa  209  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  29.91 
 
 		 533 aa  207  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  30.81 
 
 		 515 aa  207  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  30.75 
 
 		 472 aa  207  8e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  32.16 
 
 		 533 aa  206  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0733  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.93 
 
 		 1400 aa  205  3e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  32.05 
 
 		 535 aa  205  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  31.33 
 
 		 594 aa  204  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  32.24 
 
 		 526 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  30.24 
 
 		 503 aa  202  3e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  28.99 
 
 		 530 aa  202  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  29.42 
 
 		 532 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  30.32 
 
 		 533 aa  201  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  35.01 
 
 		 461 aa  201  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>