More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0079 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 515 aa  1027    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  45.51 
 
 		 468 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  42.74 
 
 		 462 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  43.37 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3104  protein-export membrane protein SecD  42.06 
 
 		 538 aa  330  4e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000111638  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  38.88 
 
 		 470 aa  298  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  40.36 
 
 		 464 aa  297  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  38.06 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  41.18 
 
 		 495 aa  294  2e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  40.58 
 
 		 471 aa  289  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  40.04 
 
 		 493 aa  289  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  40.22 
 
 		 470 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  40.22 
 
 		 470 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  39.3 
 
 		 474 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  38.54 
 
 		 489 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  39.47 
 
 		 532 aa  274  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  39.37 
 
 		 533 aa  272  9e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  38.5 
 
 		 533 aa  272  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  37.74 
 
 		 495 aa  269  8e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  39.37 
 
 		 533 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  38.98 
 
 		 534 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  36.58 
 
 		 461 aa  267  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  40.26 
 
 		 464 aa  266  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  48.25 
 
 		 410 aa  266  8e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  36.72 
 
 		 486 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0313  preprotein translocase subunit SecD  37.37 
 
 		 449 aa  264  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119854  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  38.6 
 
 		 533 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  39.37 
 
 		 457 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  34.56 
 
 		 496 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  34.66 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  38.6 
 
 		 533 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  36.21 
 
 		 489 aa  260  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  47.37 
 
 		 416 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  37.58 
 
 		 449 aa  259  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  47.35 
 
 		 399 aa  259  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  37.15 
 
 		 533 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  36.53 
 
 		 594 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  36.53 
 
 		 594 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  34.48 
 
 		 496 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  33.67 
 
 		 487 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.69 
 
 		 853 aa  252  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  35.58 
 
 		 535 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  36.04 
 
 		 622 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  37.23 
 
 		 525 aa  250  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.31 
 
 		 848 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.63 
 
 		 849 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  35.63 
 
 		 533 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  34.6 
 
 		 533 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  45.62 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  45.62 
 
 		 419 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  34.43 
 
 		 535 aa  247  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  36.79 
 
 		 554 aa  246  6.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  44.11 
 
 		 413 aa  246  9e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  48.15 
 
 		 403 aa  246  9e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  33.95 
 
 		 554 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  34.51 
 
 		 487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  34.63 
 
 		 531 aa  245  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  35.61 
 
 		 556 aa  243  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  35.02 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.23 
 
 		 856 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.32 
 
 		 839 aa  239  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  34.72 
 
 		 537 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  36.56 
 
 		 843 aa  237  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.39 
 
 		 856 aa  237  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  34.29 
 
 		 532 aa  237  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  34.34 
 
 		 503 aa  236  7e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  34.23 
 
 		 530 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  35.76 
 
 		 613 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  33.63 
 
 		 532 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  35.54 
 
 		 613 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 594 aa  233  6e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  32.52 
 
 		 532 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  35.11 
 
 		 533 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  35.32 
 
 		 613 aa  233  9e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  35.55 
 
 		 533 aa  232  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  45.07 
 
 		 415 aa  231  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  32.3 
 
 		 554 aa  231  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  34.57 
 
 		 554 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  34.87 
 
 		 740 aa  231  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  33.77 
 
 		 632 aa  230  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  39.84 
 
 		 449 aa  230  5e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  33.48 
 
 		 632 aa  229  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  34.67 
 
 		 532 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  35.09 
 
 		 636 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  44.95 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  32.77 
 
 		 607 aa  227  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  31.37 
 
 		 530 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  33.55 
 
 		 632 aa  226  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  33.58 
 
 		 554 aa  226  8e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  33.58 
 
 		 554 aa  226  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  35.28 
 
 		 535 aa  226  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  43.36 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0681  preprotein translocase subunit SecD  33.11 
 
 		 587 aa  225  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.58 
 
 		 844 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  35.27 
 
 		 530 aa  224  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  34.98 
 
 		 531 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  31.49 
 
 		 534 aa  223  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  34.11 
 
 		 531 aa  223  8e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  34.27 
 
 		 640 aa  223  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  31.43 
 
 		 532 aa  223  9e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>