More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1571 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 503 aa  1000    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  44.19 
 
 		 525 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  45.29 
 
 		 530 aa  307  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  45.5 
 
 		 531 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  37.2 
 
 		 473 aa  303  6.000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  43.89 
 
 		 535 aa  302  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  41.63 
 
 		 406 aa  297  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  43.51 
 
 		 524 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  39.95 
 
 		 533 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  42.71 
 
 		 533 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0681  preprotein translocase subunit SecD  39.86 
 
 		 587 aa  294  3e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  37.82 
 
 		 532 aa  293  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.13 
 
 		 856 aa  292  9e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  40.55 
 
 		 533 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  41.07 
 
 		 533 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  34.11 
 
 		 594 aa  291  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  44.22 
 
 		 554 aa  290  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  39.91 
 
 		 399 aa  289  6e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  40.77 
 
 		 534 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  41.29 
 
 		 530 aa  289  6e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  43.28 
 
 		 533 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.79 
 
 		 856 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  38.58 
 
 		 535 aa  286  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  38.08 
 
 		 532 aa  286  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  41.01 
 
 		 532 aa  285  9e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  40.93 
 
 		 533 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  38.62 
 
 		 533 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  41.12 
 
 		 530 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  42.19 
 
 		 533 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  39.8 
 
 		 843 aa  283  7.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  40.49 
 
 		 532 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  38.02 
 
 		 532 aa  282  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  42.34 
 
 		 531 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  39.85 
 
 		 508 aa  280  4e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  41.24 
 
 		 554 aa  279  7e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  42.56 
 
 		 556 aa  279  7e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  41.24 
 
 		 554 aa  279  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  39.12 
 
 		 505 aa  278  1e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  41.75 
 
 		 554 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  41.54 
 
 		 554 aa  278  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  41.43 
 
 		 533 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  43.38 
 
 		 512 aa  277  3e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.95 
 
 		 853 aa  276  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  40.7 
 
 		 533 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  39.23 
 
 		 594 aa  276  9e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  39.23 
 
 		 594 aa  276  9e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  41.64 
 
 		 534 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  32.3 
 
 		 605 aa  274  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  42.08 
 
 		 532 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  41.42 
 
 		 533 aa  273  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  40.05 
 
 		 534 aa  273  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  41.67 
 
 		 535 aa  273  8.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  31.99 
 
 		 595 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  40.05 
 
 		 532 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0672  preprotein translocase subunit SecD  34.62 
 
 		 586 aa  270  2.9999999999999997e-71  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  39.79 
 
 		 534 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.88 
 
 		 839 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  38.87 
 
 		 531 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.51 
 
 		 849 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  42.82 
 
 		 529 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  37.28 
 
 		 522 aa  266  5e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  40.58 
 
 		 526 aa  266  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  39.46 
 
 		 501 aa  266  7e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0627  protein-export membrane protein SecD  40.37 
 
 		 502 aa  266  7e-70  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57035  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  41.36 
 
 		 623 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  38.99 
 
 		 534 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  39.8 
 
 		 526 aa  264  2e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  42.15 
 
 		 632 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  36.34 
 
 		 413 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  40.62 
 
 		 533 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.74 
 
 		 848 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  40.58 
 
 		 632 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  35.88 
 
 		 416 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  37.94 
 
 		 526 aa  259  6e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  40.11 
 
 		 625 aa  259  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  40.36 
 
 		 532 aa  259  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  40.36 
 
 		 532 aa  259  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  37.63 
 
 		 554 aa  259  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  40.31 
 
 		 632 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  40.96 
 
 		 537 aa  258  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  36.66 
 
 		 403 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  37.32 
 
 		 403 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  31.6 
 
 		 619 aa  257  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0013  preprotein translocase subunit SecD  30.73 
 
 		 624 aa  256  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  38.57 
 
 		 510 aa  254  4.0000000000000004e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1240  protein translocase subunit  36.57 
 
 		 622 aa  253  7e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00253338  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1303  protein-export membrane protein SecD  40.05 
 
 		 622 aa  252  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1291  protein-export membrane protein SecD  36.57 
 
 		 622 aa  252  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.00000000000000635694  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  39.21 
 
 		 551 aa  250  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  31.14 
 
 		 607 aa  249  6e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  38.57 
 
 		 521 aa  249  9e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.29 
 
 		 981 aa  248  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  39.63 
 
 		 457 aa  248  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  39.27 
 
 		 521 aa  248  2e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  47.79 
 
 		 622 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2184  protein-export membrane protein SecD  40.9 
 
 		 620 aa  247  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  35.15 
 
 		 849 aa  246  4.9999999999999997e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  34.51 
 
 		 461 aa  246  6.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1331  protein-export membrane protein SecD  39.23 
 
 		 625 aa  246  9e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0264501  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3866  preprotein translocase subunit SecD  41.88 
 
 		 626 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>