More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0935 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  53.66 
 
 
763 aa  743    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  62.7 
 
 
754 aa  928    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  62.83 
 
 
754 aa  929    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  62.7 
 
 
754 aa  929    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  62.57 
 
 
754 aa  924    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  53.35 
 
 
759 aa  722    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  62.7 
 
 
754 aa  929    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  62.83 
 
 
754 aa  928    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  62.83 
 
 
754 aa  929    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  100 
 
 
750 aa  1501    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  62.7 
 
 
754 aa  931    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  62.83 
 
 
754 aa  929    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  83.87 
 
 
750 aa  1263    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  53.35 
 
 
759 aa  722    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  63.31 
 
 
752 aa  944    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  62.43 
 
 
755 aa  920    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  35.96 
 
 
735 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  31.64 
 
 
761 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  32.33 
 
 
989 aa  338  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.56 
 
 
856 aa  332  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.06 
 
 
856 aa  332  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  30.47 
 
 
759 aa  322  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  32.24 
 
 
740 aa  315  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  29.65 
 
 
849 aa  312  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  28.73 
 
 
977 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.7 
 
 
853 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.04 
 
 
991 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.7 
 
 
995 aa  304  3.0000000000000004e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.03 
 
 
848 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.11 
 
 
845 aa  301  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  31.17 
 
 
734 aa  300  5e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.97 
 
 
844 aa  299  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  30.52 
 
 
855 aa  299  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.5 
 
 
839 aa  299  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.22 
 
 
849 aa  297  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  31.81 
 
 
843 aa  295  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.53 
 
 
785 aa  295  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.53 
 
 
785 aa  295  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.94 
 
 
762 aa  295  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.36 
 
 
759 aa  292  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  31.29 
 
 
748 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.75 
 
 
996 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  31.97 
 
 
1029 aa  286  8e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.67 
 
 
834 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.83 
 
 
846 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.56 
 
 
844 aa  283  8.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  31.67 
 
 
900 aa  283  9e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.03 
 
 
756 aa  281  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.56 
 
 
990 aa  280  7e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.03 
 
 
1055 aa  279  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.92 
 
 
981 aa  278  2e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.24 
 
 
991 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.66 
 
 
844 aa  278  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  30.48 
 
 
1001 aa  275  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.94 
 
 
911 aa  270  8e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.96 
 
 
846 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  40.51 
 
 
419 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  40.51 
 
 
419 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  40.14 
 
 
403 aa  263  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1073  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.2 
 
 
753 aa  260  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0361267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2102  protein-export membrane protein SecD  38.7 
 
 
433 aa  253  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.459213  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.12 
 
 
995 aa  245  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  37.59 
 
 
411 aa  239  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0733  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.83 
 
 
1400 aa  239  2e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  37.19 
 
 
413 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  36.41 
 
 
461 aa  236  8e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2101  protein-export membrane protein SecF  43 
 
 
308 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  36.07 
 
 
416 aa  236  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  39.79 
 
 
411 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1501  protein-export membrane protein SecD  27.54 
 
 
793 aa  233  8.000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.365573  normal  0.0601553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  35.81 
 
 
464 aa  233  9e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  35.01 
 
 
403 aa  233  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  35.57 
 
 
423 aa  231  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  35.66 
 
 
415 aa  231  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  28.6 
 
 
885 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  35.73 
 
 
410 aa  224  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  32.92 
 
 
471 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  36.47 
 
 
406 aa  224  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  34.67 
 
 
399 aa  221  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  33.26 
 
 
470 aa  221  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  34.95 
 
 
474 aa  220  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  31.82 
 
 
461 aa  218  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  34.01 
 
 
464 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  32.12 
 
 
470 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  32.12 
 
 
470 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  35.41 
 
 
532 aa  210  7e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  40 
 
 
296 aa  209  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  41.61 
 
 
291 aa  209  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  35.24 
 
 
533 aa  208  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  35.25 
 
 
533 aa  203  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  33.92 
 
 
534 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.52 
 
 
858 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  34.37 
 
 
533 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  31.04 
 
 
515 aa  201  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  34.26 
 
 
533 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  31.67 
 
 
493 aa  201  5e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  30.23 
 
 
489 aa  201  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  34.18 
 
 
554 aa  201  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  31.81 
 
 
495 aa  200  7e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  32.67 
 
 
616 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>