More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1356 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 410 aa  812    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  58.92 
 
 		 411 aa  485  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  58.58 
 
 		 416 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  56.99 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  48.02 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  50 
 
 		 735 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  47.55 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  46.3 
 
 		 403 aa  342  9e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  44.63 
 
 		 399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  43.43 
 
 		 411 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  40.1 
 
 		 419 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  40.1 
 
 		 419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  40.6 
 
 		 415 aa  299  5e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  41.33 
 
 		 406 aa  288  8e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  37.74 
 
 		 461 aa  285  7e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  40.95 
 
 		 423 aa  285  9e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  40.71 
 
 		 594 aa  282  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  40.71 
 
 		 594 aa  282  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  38.65 
 
 		 470 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  39.66 
 
 		 533 aa  276  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  39.46 
 
 		 533 aa  276  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  39.39 
 
 		 532 aa  276  6e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  39.94 
 
 		 534 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  40.34 
 
 		 533 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  39.54 
 
 		 464 aa  269  5.9999999999999995e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  37.99 
 
 		 533 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  41.08 
 
 		 531 aa  267  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  43.04 
 
 		 524 aa  265  7e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  48.25 
 
 		 515 aa  265  8e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  40.34 
 
 		 533 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  40.06 
 
 		 533 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.42 
 
 		 856 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  38.16 
 
 		 535 aa  263  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  37.24 
 
 		 537 aa  263  4e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  37.68 
 
 		 740 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  40.16 
 
 		 530 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  37.96 
 
 		 474 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  38.73 
 
 		 759 aa  259  4e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  39.68 
 
 		 531 aa  259  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  36.5 
 
 		 473 aa  259  5.0000000000000005e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  38.98 
 
 		 532 aa  258  9e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  37.06 
 
 		 530 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  39.1 
 
 		 525 aa  257  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  40 
 
 		 534 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  35.58 
 
 		 554 aa  256  7e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  38.44 
 
 		 533 aa  255  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  36.69 
 
 		 533 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  38.01 
 
 		 532 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  36.55 
 
 		 530 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  39.34 
 
 		 533 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  38.71 
 
 		 532 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  35.36 
 
 		 468 aa  253  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  38.71 
 
 		 532 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  34.77 
 
 		 533 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  38.38 
 
 		 531 aa  252  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  39.14 
 
 		 534 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  37.76 
 
 		 632 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.93 
 
 		 848 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  38.38 
 
 		 534 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  36.13 
 
 		 556 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  34.9 
 
 		 474 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  36.17 
 
 		 532 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.06 
 
 		 856 aa  249  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.93 
 
 		 849 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  39.89 
 
 		 535 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  36.53 
 
 		 554 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  38.67 
 
 		 632 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  37.95 
 
 		 533 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  35.64 
 
 		 532 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  36.04 
 
 		 554 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  37.94 
 
 		 625 aa  245  9e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  35.75 
 
 		 535 aa  245  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  36.96 
 
 		 532 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  39.73 
 
 		 636 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  35.2 
 
 		 487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  38.13 
 
 		 632 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  35.5 
 
 		 554 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  35.5 
 
 		 554 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  36.87 
 
 		 464 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  34.05 
 
 		 441 aa  243  5e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  38.38 
 
 		 526 aa  242  9e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.99 
 
 		 853 aa  242  9e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  37.08 
 
 		 471 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  35.99 
 
 		 445 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  40.11 
 
 		 621 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  38.54 
 
 		 843 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  34.1 
 
 		 503 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  36.24 
 
 		 554 aa  240  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  39.2 
 
 		 640 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  35.46 
 
 		 533 aa  239  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  37.89 
 
 		 521 aa  239  5.999999999999999e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  34.61 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  36.92 
 
 		 534 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  40.52 
 
 		 595 aa  237  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.55 
 
 		 839 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  42.66 
 
 		 619 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  36.8 
 
 		 532 aa  235  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3866  preprotein translocase subunit SecD  38.54 
 
 		 626 aa  235  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  38.9 
 
 		 623 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  36.18 
 
 		 521 aa  234  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>