More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1501 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1501  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 793 aa  1609    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.365573  normal  0.0601553 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  34.15 
 
 		 849 aa  392  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  33.38 
 
 		 759 aa  318  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  32.53 
 
 		 740 aa  310  6.999999999999999e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  35.28 
 
 		 1029 aa  308  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.47 
 
 		 995 aa  304  5.000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.16 
 
 		 856 aa  303  9e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  30.8 
 
 		 735 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  33.75 
 
 		 1001 aa  298  3e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.8 
 
 		 856 aa  298  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.09 
 
 		 991 aa  292  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  29.97 
 
 		 761 aa  291  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.42 
 
 		 762 aa  291  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.7 
 
 		 849 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.46 
 
 		 996 aa  287  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.83 
 
 		 848 aa  286  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.35 
 
 		 853 aa  283  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  33.8 
 
 		 989 aa  278  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.3 
 
 		 846 aa  277  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  32.43 
 
 		 843 aa  277  6e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.73 
 
 		 995 aa  276  7e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.22 
 
 		 990 aa  273  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_002620  TC0733  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.97 
 
 		 1400 aa  272  2e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.24 
 
 		 839 aa  270  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.45 
 
 		 846 aa  270  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.61 
 
 		 991 aa  265  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.36 
 
 		 785 aa  264  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.36 
 
 		 785 aa  264  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.48 
 
 		 759 aa  263  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.94 
 
 		 981 aa  262  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.73 
 
 		 1055 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.41 
 
 		 834 aa  258  4e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.68 
 
 		 844 aa  257  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.09 
 
 		 844 aa  254  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.07 
 
 		 845 aa  242  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  30.58 
 
 		 885 aa  241  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  34.86 
 
 		 748 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.92 
 
 		 844 aa  238  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.5 
 
 		 756 aa  238  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.54 
 
 		 750 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.96 
 
 		 750 aa  233  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.01 
 
 		 858 aa  232  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.51 
 
 		 759 aa  228  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.51 
 
 		 759 aa  228  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.53 
 
 		 763 aa  226  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.9 
 
 		 754 aa  213  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  25.98 
 
 		 855 aa  213  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.9 
 
 		 754 aa  212  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.24 
 
 		 752 aa  213  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.03 
 
 		 754 aa  211  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.03 
 
 		 754 aa  211  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.03 
 
 		 754 aa  211  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.72 
 
 		 755 aa  210  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.9 
 
 		 754 aa  210  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.9 
 
 		 754 aa  210  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1349  protein-export membrane protein SecD  30.14 
 
 		 997 aa  209  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.853966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.9 
 
 		 754 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  28.15 
 
 		 734 aa  209  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.9 
 
 		 754 aa  208  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  39.22 
 
 		 530 aa  207  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  32.21 
 
 		 461 aa  205  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  33.55 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  32.16 
 
 		 464 aa  200  9e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  36.39 
 
 		 532 aa  198  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  34.59 
 
 		 465 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1407  secretion protein SecD  33.92 
 
 		 622 aa  194  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0970542  normal  0.495357 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  36.8 
 
 		 531 aa  194  6e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  43.96 
 
 		 622 aa  194  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  35.29 
 
 		 465 aa  193  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01347  preprotein translocase subunit SecD  36.29 
 
 		 599 aa  193  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3262  preprotein translocase subunit SecD  36.08 
 
 		 604 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3382  preprotein translocase subunit SecD  36.08 
 
 		 615 aa  192  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00120261  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3121  preprotein translocase subunit SecD  36.08 
 
 		 615 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  32.7 
 
 		 472 aa  192  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  35.05 
 
 		 615 aa  189  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1073  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.7 
 
 		 753 aa  188  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0361267  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  36.75 
 
 		 532 aa  188  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  34.74 
 
 		 594 aa  188  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  34.74 
 
 		 594 aa  188  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  35.26 
 
 		 614 aa  187  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  34.48 
 
 		 532 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  34.56 
 
 		 533 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  35.53 
 
 		 533 aa  185  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2433  preprotein translocase subunit SecD  34.83 
 
 		 618 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1292  preprotein translocase subunit SecD  33.75 
 
 		 620 aa  184  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  32.61 
 
 		 530 aa  184  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  36.79 
 
 		 526 aa  184  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  31.35 
 
 		 423 aa  183  9.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  36.92 
 
 		 613 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  34.94 
 
 		 616 aa  183  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14630  preprotein translocase subunit SecD  33.5 
 
 		 620 aa  183  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  36.88 
 
 		 533 aa  183  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  36.73 
 
 		 613 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  36.73 
 
 		 613 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0478  preprotein translocase subunit SecD  35.05 
 
 		 615 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0438  preprotein translocase subunit SecD  35.05 
 
 		 615 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0327  preprotein translocase subunit SecD  35.05 
 
 		 615 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.328268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0488  preprotein translocase subunit SecD  35.05 
 
 		 615 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0440  preprotein translocase subunit SecD  35.05 
 
 		 615 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00360  hypothetical protein  35.05 
 
 		 615 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.674482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>