More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_12260 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 403 aa  800    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  48.53 
 
 		 416 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  46.88 
 
 		 461 aa  354  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  48.13 
 
 		 411 aa  353  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  46.74 
 
 		 413 aa  345  7e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  45.58 
 
 		 410 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  45.87 
 
 		 735 aa  325  6e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  43.83 
 
 		 403 aa  323  4e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  43.6 
 
 		 406 aa  322  7e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  42.97 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  41.75 
 
 		 423 aa  300  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  46.09 
 
 		 411 aa  292  7e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  39.86 
 
 		 415 aa  288  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  42.78 
 
 		 532 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  42.51 
 
 		 533 aa  282  8.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  38.78 
 
 		 471 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  38.24 
 
 		 464 aa  280  3e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  41.87 
 
 		 534 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  41.8 
 
 		 533 aa  279  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  37.76 
 
 		 419 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  37.76 
 
 		 419 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  42.13 
 
 		 535 aa  277  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  39.55 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  38.19 
 
 		 461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  42.11 
 
 		 533 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  36.38 
 
 		 470 aa  273  4.0000000000000004e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  39.33 
 
 		 449 aa  272  7e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  40.52 
 
 		 535 aa  272  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.6 
 
 		 856 aa  272  7e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0313  preprotein translocase subunit SecD  39.1 
 
 		 449 aa  272  9e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119854  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  40.43 
 
 		 531 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  41.53 
 
 		 531 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  40.16 
 
 		 530 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  39.74 
 
 		 525 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  39.84 
 
 		 594 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  39.84 
 
 		 594 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  41.93 
 
 		 554 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  39.26 
 
 		 554 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  37.21 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  39.26 
 
 		 554 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  40.6 
 
 		 533 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.53 
 
 		 856 aa  266  7e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  38.54 
 
 		 554 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  41.05 
 
 		 532 aa  264  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  43.21 
 
 		 533 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  37.82 
 
 		 533 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  39.63 
 
 		 533 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  38.58 
 
 		 533 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  37.78 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  37.78 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  37.96 
 
 		 530 aa  259  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  37.73 
 
 		 532 aa  259  6e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  36.68 
 
 		 632 aa  259  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  37.56 
 
 		 532 aa  259  8e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  37.63 
 
 		 554 aa  258  9e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  36.49 
 
 		 503 aa  258  1e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  37.87 
 
 		 740 aa  258  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  40.79 
 
 		 556 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  39.02 
 
 		 468 aa  257  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  39.71 
 
 		 534 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  37.87 
 
 		 533 aa  256  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.27 
 
 		 853 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  37.2 
 
 		 761 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  36.36 
 
 		 554 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2715  preprotein translocase subunit SecD  36.73 
 
 		 626 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.177706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  36.75 
 
 		 464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  39.17 
 
 		 533 aa  253  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  39.07 
 
 		 748 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  36.52 
 
 		 632 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  37.91 
 
 		 534 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  36 
 
 		 530 aa  249  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  37.85 
 
 		 532 aa  250  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  37.59 
 
 		 474 aa  250  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.89 
 
 		 849 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  38.22 
 
 		 616 aa  249  8e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.77 
 
 		 848 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  36.27 
 
 		 632 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  39.14 
 
 		 843 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  36.97 
 
 		 625 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  38.67 
 
 		 532 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  38.67 
 
 		 532 aa  247  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  38.08 
 
 		 636 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  37.34 
 
 		 534 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2527  preprotein translocase subunit SecD  36 
 
 		 681 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.92 
 
 		 756 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  38.41 
 
 		 623 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  42.38 
 
 		 524 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  37.29 
 
 		 532 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  48.15 
 
 		 515 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  34.87 
 
 		 473 aa  246  8e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  37.56 
 
 		 759 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  36.95 
 
 		 604 aa  243  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3992  preprotein translocase subunit SecD  35.61 
 
 		 695 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.725975  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2959  preprotein translocase subunit SecD  36.27 
 
 		 629 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  35.75 
 
 		 621 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2350  preprotein translocase subunit SecD  37.47 
 
 		 618 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.951904  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0701  preprotein translocase subunit SecD  35.61 
 
 		 687 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  44.57 
 
 		 613 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  37.85 
 
 		 533 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2549  preprotein translocase subunit SecD  36 
 
 		 629 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370381  normal  0.188242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>